Eu concordo com você e sua preocupação em adicionar a diretiva " pci = nomsi, noaer " nas diretivas grub para simplesmente suprimir o relatório de erros. Com problemas sérios, é preciso ter os erros relatados para que possamos corrigi-los, algo que não acontecerá com " pci = nomsi, noaer ", uma diretiva projetada para suprimir essas mensagens de erro valiosas.
Por acaso, encontrei esse tópico do fórum pesquisando a mensagem " no irq handler for vector " que aparece demais quando eu inicializo o multi-user.target (login apenas com texto). O erro é extremamente persistente, dificultando a digitação de comandos, pois aparece em todos os ttys, mesmo enquanto estou digitando um comando.
Respondendo à sua pergunta original; adicionar a diretiva " pci = nomsi, noaer " no grub prejudicará seu sistema? Eu teria que dizer "não", que a própria diretiva causaria algum dano. NO ENTANTO , algo está errado com seu sistema e suprimir a mensagem de erro não ajuda a corrigir o problema e, qualquer que seja o problema original, PODE (o problema real indicado por uma mensagem de erro) causar danos ao seu sistema.
Considere isto; um homem está com febre, então você lhe dá Tylenol e a febre desaparece, mas ele morre de uma infecção maciça porque não lhe demos os antibióticos de que ele realmente precisava. Resolver a mensagem de erro não ajudará ou prejudicará seu sistema, mas talvez ignore o problema original!
Pelo que vale a pena, ainda estou tentando descobrir como corrigir o problema que causa o erro " sem manipulador de irq para vetor " que assume meu login com base em texto. Sei que os IRQs (solicitações de interrupção) são frequentemente usados por dispositivos de hardware para chamar a atenção da CPU e, como tenho tido problemas com vários dispositivos de hardware, o erro é consistente com meus problemas de hardware.
Espero que você encontre uma solução para o seu problema.