Eu pessoalmente uso POL exclusivamente.
Não há necessidade de usar o Wine além do POL. O POL oferece uma maneira de adicionar manualmente software que ainda não é suportado pelos scripts de POL (os scripts de instalação que devem fazer a configuração do processo de instalação de cada software individualmente) e você tem muitas ferramentas incorporadas, como o editor de registro, para editar o registro. valores de qualquer software instalado, winetricks e muito mais.
Mas a conveniência mais importante para mim é a possibilidade de alternar entre as versões instaladas do vinho (digamos que você instalou quatro aplicativos com quatro versões diferentes do vinho em quatro prefixos diferentes (bem, você não - os scripts POL fizeram), então você pode alternar o versão wine para qualquer aplicativo "system" (usando o padrão do sistema) para qualquer outra versão que foi usada anteriormente pela POL). Isso é realmente conveniente.
Não vejo nenhuma razão para usar vinho puro além do POL.
meu 2c, piedro