O Eclipse vem com configurações diferentes, mas sempre há o mesmo "eclipse" que o aplicativo principal. Eles são o mesmo Eclipse com diferentes coleções de plug-ins que você pode instalar, remover e atualizar através do gerenciador de pacotes integrado no próprio Eclipse. É por isso que você não consegue encontrar o Eclipse desejado com um gerenciador de pacotes apt.
Você também não precisa instalar o eclipse ou o java (a versão .bin do site Oracle), eles podem ser descompactados em uma pasta local; por exemplo, você pode descompactar esses dois na sua pasta pessoal e adicionar a -vm
opção eclipse.ini
ou iniciar eclipse com a -vm
opção, exemplo:
\local\path\to\eclipse -vm \local\path\to\the\java\machine\used_by_eclipse