Você é afetado por esse bug, que parece afetar os kernels 4.2 - 4.4. Sugiro que você assine o bug para que você seja notificado sobre o progresso e que os desenvolvedores tenham uma idéia melhor do impacto que está causando. Conforme mencionado nesta resposta pelo usuário 1783630 De acordo com o autor do bug, uma solução funcional é desativar o XHC1 antes de dormir, emitindo o comando
echo XHC1 > /proc/acpi/wakeup
No entanto, o conteúdo atual de / proc / acpi / wakeup no meu sistema 16.04 é um pouco mais complexo do que o composto por 4 colunas de informações que abrangem os dispositivos Device, S-state, status e sysfs, então não estou convencido de que esse seja o caminho a percorrer com o Ubuntu. O bug já foi confirmado e triado, então espero que isso seja resolvido com um kernel mais recente.
Editar: Esta pergunta relacionada também possui algumas boas respostas que você pode modificar para se adequar às suas circunstâncias
Fonte:
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/linux/+bug/1507472