Isso é mais uma festa de alto nível em uma resposta.
O projeto android foi amplamente fundido no kernel do linux há algum tempo. Suspeito que o primeiro passo seja revisar o que foi incluído nessas fusões. Você precisaria recompilar o kernel para acomodar essas alterações. Eu acho que eles incluíram amplamente coisas para tornar um sistema estável estável, os telefones são ligados e desligados o tempo todo os servidores não.
A próxima etapa deve verificar se os drivers Linux para esse chipset acomodam a funcionalidade que você precisa habilitar. Nesse caso, há uma grande chance de você ativar a chamada. Talvez você precise ler o driver para ativar realmente as chamadas e assim por diante.
Suspeito que possa ser realmente trivial acertar se você puder enviar comandos AT para o chip e conseguir discá-lo ou responder a chamadas. O truque é conectar o microfone e o alto-falante às conexões que ele abrir. Dado que é linux, pode até ser tão trivial quanto conectar seu dispositivo de microfone ao transmissor de chips de telefone, mas estou apenas tentando adivinhar.