Respostas:
Você pode usar o clamav for Linux para verificar quaisquer discos conectados ao seu sistema. O ClamAV possui um front-end gráfico chamado ClamTK. É um dos mais conhecidos, é gratuito e você pode instalá-lo nos repositórios.
Quanto a outras versões do antivírus para Linux, você pode ter:
Alguns deles são gratuitos, pelo menos o AVAST parece ser uma versão paga para a segurança da empresa.