O VirtualBox alega suporte a esse recurso, de acordo com o manual :
Essencialmente, esse recurso permite o uso direto de dispositivos PCI físicos no host pelo hóspede, mesmo que o host não possua drivers para esse dispositivo em particular. Ambos, PCI regular e algumas placas PCI Express, são suportados. O AGP e certas placas PCI Express não são suportadas no momento se elas dependem da programação da unidade GART (Graphics Address Remapping Table) para gerenciamento de texturas, pois realizam operações não triviais com remapeamento de páginas que interferem no IOMMU. Essa limitação pode ser levantada em versões futuras.
[...]
A solução da Intel para IOMMU é comercializada como "Tecnologia de virtualização Intel para E / S direcionada" (VT-d), e a da AMD é chamada AMD-Vi. Portanto, verifique se a folha de dados da sua placa-mãe possui a tecnologia apropriada. Mesmo que o seu hardware não tenha um IOMMU, certas placas PCI podem funcionar (como adaptadores PCI seriais), mas o convidado exibirá um aviso na inicialização e a execução da VM será encerrada se o driver convidado tentar ativar o domínio do barramento da placa .
Quanto ao VMware, não encontrei nada conclusivo, mas encontrei esta pergunta relacionada no Superusuário com uma resposta:
Mas isso realmente não importa para você desde o VT-d, não é suportado no Vmware Workstation [...]
O VT-d pode potencialmente trazer alguma melhoria de desempenho, pois seu objetivo é permitir que máquinas virtuais usem dispositivos de hardware sem manipulação extra do host.