O exFAT e o NTFS são sistemas de arquivos proprietários da Microsoft. O exFAT, também chamado de FAT64, é um sistema de arquivos muito simples, praticamente uma extensão do FAT32, devido à sua simplicidade, é bem implementado no Linux e muito rápido.
Mas, devido à sua estrutura fácil, é facilmente afetada pela fragmentação, portanto, o desempenho pode diminuir facilmente com o uso.
O exFAT não suporta registro no diário, o que significa que ele precisa de verificação completa em caso de desligamento imundo.
O NTFS é mais lento que o exFAT, especialmente no Linux, mas é mais resistente à fragmentação. Devido à sua natureza proprietária, ele não é tão bem implementado no Linux quanto no Windows, mas, pela minha experiência, funciona muito bem. Em caso de corrupção, o NTFS pode ser facilmente reparado no Windows (até no Linux existe ntfsfix
) e existem muitas ferramentas capazes de recuperar arquivos perdidos.
Pessoalmente, prefiro NTFS por sua confiabilidade. Outra opção é usar ext4 e montar no Windows com extfsd , ext4 é melhor no Linux, mas o driver não está bem implementado no Windows. O Extfsd não suporta totalmente o registro no diário, portanto, existe o risco de escrever no Windows, mas o ext é mais fácil de reparar no Linux do que o exFAT.