Consegui fazer o GNU Screen começar a contar janelas com o número 1 em vez do padrão 0 com este código no meu .screenrc:
# Get rid of screen 0
bind c screen 1
bind ^c screen 1
bind 0 select 10
Quando criei janelas no .screenrc, usei screen 1
para que ele tentasse primeiro 1 e depois contasse se esse número fosse obtido.