Apenas "sombreado" e estará lá novamente quando desmontado. :)
De fato, os arquivos estão "lá" intactos e se você precisar alcançá-los imediatamente, sem desmontar, isso pode ser contornado com o chamado bind
mount:
mount --bind /Original/FS/Mount/Point /Somewhere/Else
Funciona (então) porque quando você pede ao kernel para montar um sistema de arquivos em algum ponto de montagem, o kernel trata esse ponto de montagem como uma "porta de visualização" para o sistema de arquivos que você está montando, então é esperado que você veja o FS montado conteúdo lá.
Mas essa não é a única maneira de combinar essas "camadas" de FSes em uma única exibição. Existe a chamada abordagem " união montada " (é engraçado saber que isso "é um conceito central no Plano 9", aliás). No Linux, você poderia usar o Aufs , que nunca chegou ao kernel da linha principal, ou, atualmente (desde a versão 3.18), o OverlayFS - ele fez .