Uma barra invertida fora das aspas significa "interpretar o próximo caractere literalmente durante a análise". Como .é um caractere comum para o analisador, \.é analisado da mesma maneira que .e invoca o builtin .(que sourceé sinônimo no bash).
Há um caso em que isso pode fazer diferença nesse contexto. Se um usuário definiu um alias chamado .anteriormente .profilee .profileestá sendo lido em um shell que expande aliases (o que o bash somente faz por padrão quando é chamado de maneira interativa), .ele acionaria o alias, mas \.ainda assim ativaria o builtin, porque o shell não tenta a expansão de alias em palavras que foram citadas de qualquer forma.
Eu suspeito que isso .foi alterado para \.porque um usuário reclamou depois de criar um alias para ..
Observe que \.chamaria uma função chamada .. Presumivelmente, os usuários que escrevem funções têm mais conhecimento do que os usuários que escrevem aliases e saberiam que redefinir um comando padrão .profileé uma má idéia se você incluir códigos de terceiros. Mas se você quiser ignorar os aliases e as funções, poderá escrever command .. O autor deste trecho também não fez isso porque se importava com conchas antigas que não tinham o commandinterior, ou mais provavelmente porque não o conheciam.
A propósito, definir qualquer apelido .profileé uma péssima idéia, porque .profileé um script de inicialização da sessão , não um script de inicialização do shell . Aliases para bash pertencem a .bashrc.