scpé burro no sentido de que apenas copia cegamente os arquivos da origem ao destino. Se você quiser algo mais inteligente sobre como copiar arquivos, precisará usar uma ferramenta como rsync.
$ rsync -avz root@rimmer.sk:'$(find /home/rimmer/backups/ -ctime -1)' /home/rimmer/backups/
Isso copiará apenas os arquivos ausentes ou que foram alterados do diretório de backups do rimmer.sk no último dia (-ctime -1) para o diretório do backup local.
-ctime n
File's status was last changed n*24 hours ago. See the comments for
-atime to understand how rounding affects the interpretation of file
status change times.
Referências
scp -r.