Passei algum tempo pesquisando nos aplicativos do Google Drive um que convertesse os formatos do editor de documentos em PDF, mas fiquei de mãos vazias. Dito isto, os aplicativos do Drive são sempre um bom lugar para começar a procurar se você precisar de um recurso que o próprio Drive não inclua ou, nesse caso, não inclua mais.
Eu não tinha ideia de que o Google havia alterado todo o modelo de exportação de arquivos para ser tão restritivo. Acontece (como aprendi na Central de Ajuda do Drive ) que, mesmo tentando baixar um único Google Doc, na tela do navegador de arquivos do Drive, apenas produzirá um arquivo do MS Office.
Parece que a única maneira de baixar um arquivo do editor do Documentos - Documentos, Planilhas, Apresentações, etc. - como um PDF agora é abrir cada arquivo e ir para o submenu "Download como".
Isso e o Google Takeout, que também permitem fazer o download em PDF em massa, mas você mencionou que atualmente não tem acesso a isso no seu domínio do Google Apps. Talvez você possa falar com o administrador do Google Apps, principalmente se o não acesso ao Takeout prejudicar sua produtividade?