Você não pode ocultar anúncios; está nos termos e condições do AdSense em "5. Usos Proibidos":
Você não deve autorizar ou incentivar terceiros a: ... (ii) editar, modificar, filtrar, truncar ou alterar a ordem das informações contidas em qualquer anúncio, link, bloco de anúncios, resultado de pesquisa ou referência Botão ou remova, oculte ou minimize qualquer botão de Anúncio, Link, Bloco de anúncios, Resultado da pesquisa ou Referência de qualquer forma sem a autorização do Google;
Parece muito claro para mim. Provavelmente, porque o código JavaScript do anúncio ainda seria executado, reportando falsamente uma visualização do anúncio e diminuindo a taxa de cliques.
Mover o anúncio para a área do rodapé para telas estreitas usando consultas de mídia pode ser mais seguro.
Atualização (julho de 2013) : usar o JavaScript para detectar a largura da página e exibir anúncios relevantes, em vez de consultas de mídia CSS para ocultar anúncios após o carregamento da página e a contagem das visualizações, agora parece ser a opção mais sensata, como neste exemplo .