A maioria dos robôs de mecanismo de pesquisa que rastreia a Web procura por tags específicas em uma página HTML. Não acredito que eles usarão seu XSL para transformar o XML antes de tentar reconhecer as tags nessa página.
Portanto, se sua página possui uma tag <title>, <h1>, conteúdo de qualidade em tags <p>, etc ... alguns robôs podem entendê-la como html e indexá-la adequadamente como html comum.
Mas por que apostar nisso?
Se você está realmente preocupado com o SEO do seu site, pense em transformar essas páginas no servidor e apenas servir html simples aos robôs e usuários.
Além disso, confiar nos navegadores para transformar seu XML + XSL corretamente (como você espera) é uma má ideia e provavelmente está quebrada de várias maneiras do que eu posso imaginar.
Você também pode estar interessado em ler o XML + XSLT: Bom SEO? Vamos descobrir! postagem do blog que possui um link para uma discussão nos fóruns de webmasters do google.