O shortcode sempre é exibido na parte superior da página

Estou usando um código curto para obter loops diferentes através do loops-name.php. Por alguma razão, está sempre no topo da página. Eu pesquisei no Google e usar echo em vez de retornar causa esse problema, mas com meu código não estou usando echo. Aqui está o código curto:

// setup the shortcode for use
function friendly_loop_shortcode( $atts, $content = null ) {
extract( shortcode_atts( array(
'category' => '',
'module' => ''
), $atts ) );

include(locate_template('loop-'.$module.'.php'));
 }

Alguma idéia de por que isso está acontecendo?

Você pode armazenar em buffer a saída assim:

ob_start();
include(locate_template('loop-'.$module.'.php'));
return ob_get_clean();

EDITAR. Eu tentei isso, funcionou bem.

function friendly_loop_shortcode( $atts, $content = null ) {
     extract( shortcode_atts( array(
         'category' => '',
         'module' => ''
     ), $atts ) );

     ob_start();
     include(locate_template('loop-'.$module.'.php'));
     $output = ob_get_clean();
     //print $output; // debug
     return $output;
}

if (!is_admin()) {
     add_shortcode('test', 'friendly_loop_shortcode' );
}

Seu arquivo incluído é essencialmente eco de HTML. Por exemplo

<?php
 //Some PHP
 echo 'test';
 //Some more PHP
 ?>

É o mesmo que

<?php
 //Some PHP 
 ?>
 test
<?php
 //Some more PHP
 ?>

Ambos são impressos imediatamente, em vez de devolvidos. Desde a sua impressão, aparece antes do conteúdo da página. Você precisa retornar algo para que ele seja incluído no conteúdo.

Como o @RutwickGangurde apontou - é incomum incluir um arquivo de modelo em um código de acesso.