Eles ainda são comestíveis após o cozimento, mas assumem uma textura que as pessoas geralmente não gostam muito. É meio parecido com eles serem maduros, menos o escurecimento, muito macio e talvez até um pouco viscoso. O sabor muda um pouco também, mas não sei como descrevê-lo. Pode ser subjetivo (eu estou completamente acostumado a comê-los frescos), mas parece que eles estão definitivamente pior cozidos. De qualquer forma, eles não precisam ser cozidos, então por que se preocupar?
Observe que você pode aquecê-las um pouco sem esses efeitos, por exemplo, o breve cozimento das quesadillas as deixará frescas.