Eu tenho uma especulação: não há nada errado com o tamanho da sua gema, há algo errado com a sua receita.
Às vezes, as pessoas transcrevem boas receitas e entendem um pequeno detalhe errado, porque não sabem para que serve. Então, a receita é muito pior do que começou, mas se a pessoa que a divulgar não for muito discriminatória, ela poderá se tornar conhecida o suficiente para aparecer em um livro de receitas.
Não consigo imaginar uma boa razão para misturar gemas cozidas com manteiga. Por outro lado, há uma boa razão para fazê-lo se os ovos não forem cozidos. Se você mistura gemas e manteiga enquanto aquece suavemente sobre um banho de água, obtém um molho holandês, uma emulsão que pode ser usada como base para massas muito ricas e macias. Além disso, dessa forma, a manteiga se mistura perfeitamente com o restante dos ingredientes, mesmo que você não esteja usando uma batedeira.
Algumas receitas usam o atalho para não fazê-lo em um banho de água, mas para usar um ovo cozido muito macio, onde a gema acaba de atingir a temperatura adequada, mas ainda é líquida. Ainda produz uma emulsão decente, embora nenhum perfeccionista ficaria feliz.
E existem aplicações erradas dessa técnica que prescrevem um ovo cozido. Eu tentei antes para ver como funciona e descobri que, mesmo com um liquidificador moderno, é impossível fazer uma boa emulsão.
Eu posso estar errado aqui, uma massa pode falhar de várias maneiras. Mas não consigo pensar em outra razão plausível para "desnatar" a gema de ovo com manteiga. Minha sugestão é tentar outro lote, usando um método de emulsificação, e depois ver se sua massa funciona melhor.
Outro ponto que muitas pessoas esquecem com massa de biscoito: usar as temperaturas corretas é muito importante! Obviamente, neste caso, você está começando com ovos e manteiga na temperatura correta, mas os outros ingredientes também devem estar em temperatura ambiente. E se a receita prescreve períodos de resfriamento, você deve mantê-los, não tente pular as etapas de descanso ou resfriamento. Caso contrário, a consistência pode estar errada na modelagem e eles podem assar errado.