Peter Shor mostrou que dois dos mais importantes problemas intermediários de NP, fatoração e o problema de log discreto, estão no BQP. Por outro lado, o algoritmo quântico mais conhecido para SAT (busca de Grover) produz apenas uma melhoria quadrática em relação ao algoritmo clássico, sugerindo que problemas de NP-completos ainda são intratáveis em computadores quânticos. Como Arora e Barak apontam, também há um problema no BQP que não é conhecido por NP, levando à conjectura de que as duas classes são incomparáveis.
Existe algum conhecimento / conjectura sobre por que esses problemas intermediários de NP estão no BQP, mas por que o SAT (até onde sabemos) não está? Outros problemas intermediários de NP seguem essa tendência? Em particular, o isomorfismo de grafos no BQP? (este não faz uma boa busca no Google).