Deixe-me tentar fornecer uma redução bidirecional explícita que deve tornar clara a dureza FPT / W em diferentes situações (é altamente recomendável que você procure as excelentes referências nas outras respostas, pois isso é apenas algo que resolvi depois de ler sua pergunta, e eu poderia facilmente ter perdido alguma coisa).
k
(i,j)i<j
{(u,v) | (u,v)∈E(G)}
uv
Agora, aqui está uma redução ao conjunto independente: introduza um vértice para cada conjunto e adicione uma aresta entre dois conjuntos se eles compartilharem um elemento em comum. Novamente, um conjunto de conjuntos mutuamente disjuntos na família corresponde exatamente a um conjunto independente neste gráfico.
W[1]Δ=O(1)N[v]|N[v]|
É por isso que seu problema é difícil em geral e FPT no caso especial quando os tamanhos dos conjuntos na família em questão são limitados.