Respostas:
Número de confirmações.
Jenkins é um fork do Hudson (como comentado aqui ), mas tem um desenvolvimento mais ativo, o último commit do Hudson é bastante antigo. E veja os bugs abertos de Hudson
Em resumo: a comunidade. Desenvolvi recentemente um plug-in Jenkins, e o suporte ao Hudson nem me passou pela cabeça (o Jenkins tem mais plugins).
Jenkins é melhor porque
Poucos pontos mais visíveis são (do StackOverflow )