Não tenho certeza se você é um ectomorfo, mas se você está comendo o suficiente ou não é a questão. Se você não está ganhando peso, a resposta é não. Você come 6 vezes ao dia? 3 refeições principais e secundárias? Até os ectomorfos se dão bem com uma dieta rica em calorias. Para ganhar peso, você deve sempre estar em uma dieta com excesso de calorias. Você consome proteína suficiente? Se você é vegetariano, terá que encontrar maneiras de consumir proteína suficiente para ganhar massa muscular.
Sua pergunta revela algumas coisas:
Você precisa entender 60 flexões não significa necessariamente que você é forte em tudo. Você tem resistência para flexões, mas quanto pode levantar? Força é um termo muito relativo para muitas pessoas, algumas se consideram fortes quando podem correr 16 quilômetros sem soprar. Nem todas as formas de força significam que você parecerá grande ou terá massa extra. Considere os maratonistas que são principalmente magros.
O que você menciona como forma durante a academia não passa de dureza temporária dos músculos que a maioria dos iniciantes experimenta. Dado que você já mencionou que é magro, o que é uma ótima forma? Tenho certeza de que você perderá essa forma em poucas semanas se sentir falta de ir à academia. A dureza temporária é um efeito de "bomba" que ocorre quando os músculos ficam ingurgitados de sangue e é sentido por iniciantes e levantadores de longa data.
Se você nunca fez ginástica antes, sugiro que comece com um programa de treinamento de força primeiro. Isso inclui 3 dias por semana de exercícios de corpo inteiro com 5 séries de 5 repetições para cada exercício. Existem muitos programas bons, como o Strength Strength, o StrongLifts, etc. Eles definitivamente o ajudarão a aumentar. Uma descrição completa desses programas e a forma adequada dos exercícios serão difíceis de documentar nesta resposta. Esses programas basicamente se concentram em ficar mais fortes com alguns movimentos básicos; ficar maior é um efeito colateral. Eu recomendo que você pesquise esses programas e siga-os criteriosamente por alguns meses antes de concluir que come bastante ou é um ectomorfo.
Mais um ponto que gostaria de destacar é que é fácil sentir que 3 dias é muito menos exercício, mas observe que o tamanho do músculo é uma função do exercício, nutrição e descanso. Se você se exercitar sozinho, isso não aumentará de tamanho, então siga o programa, como diz Rippetoe.
Boa sorte!!