Como a normalização quantílica funciona?

Nos estudos de expressão gênica usando microarranjos, os dados de intensidade devem ser normalizados para que as intensidades possam ser comparadas entre indivíduos, entre genes. Conceitualmente e algoritmicamente, como funciona a "normalização quantílica" e como você explicaria isso a um não estatístico?

genetics normalization microarray

— Stephen Turner
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Simples: é "classificar em uma curva". :-) Dou um algoritmo em quantdec.com/envstats/notes/class_03/probability.htm ("Lendo gráficos de QQ").

— whuber

Este PDF explica a normalização quantil com um exemplo simples: plexdb.org/modules/documentation/RMAexplained.pdf O artigo está explicando um processo maior (RMA), mas a normalização quantil é realizada como uma das etapas.

— JHubbard80

Uma comparação de métodos de normalização para dados de matriz de oligonucleotídeos de alta densidade com base na variância e viés de Bolstad et al. introduz normalização quantílica para dados de matriz e compara-a a outros métodos. Ele tem uma descrição bastante clara do algoritmo.

$j$ $\hat{F}^{-1} \circ \hat{G}_j$ Onde $\hat{G}_j$ é uma função de distribuição estimada e $\hat{F}^{-1}$ é o inverso de uma função de distribuição estimada. Isso tem como consequência que as distribuições normalizadas se tornem idênticas para todas as matrizes. Para normalização quantílica $\hat{G}_j$ é a distribuição empírica da matriz $j$ e $\hat{F}$ é a distribuição empírica para os quantis médios entre matrizes.

No final do dia, é um método para transformar todas as matrizes para ter uma distribuição comum de intensidades.

— NRH
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