Que perguntas um estatístico faria sobre a análise do surto de E. coli?


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Você pode ter ouvido falar sobre o recente surto de E. coli entero- hemorrágica ( EHEC ) na Alemanha .
Que perguntas um estatístico faria sobre a análise EHEC?
Estou pensando em perguntas e respostas entre repórteres / funcionários públicos, não especialistas, dizem professores e engenheiros com diploma de mestrado ou diploma, mas, no máximo, um punhado de estatísticas.

(É possível uma imagem, um mapa da área de EHEC mostrando várias cepas de EHEC e a cobertura de vários testes?)

Segunda-feira, 20 de junho: Pensei que o surto de EHEC seria uma área em que as estatísticas realmente importam para o mundo como um todo: quais são as evidências de várias causas, como elas podem ser comunicadas ao público? Então, iniciando uma recompensa.


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Não sei se deve ser um wiki da comunidade, pois acho que os votos em boas respostas devem contar para o representante, e há uma chance de você obter respostas melhores, se for o caso.
Jeromy Anglim

Respostas:


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Se você não tem perguntas científicas a priori, deseja / precisa de respostas - eu examinaria a distribuição espacial dos casos. Em particular, eu estimaria um tipo de função espacial de "intensidade" - que é alguma função . Para que você não ajuste demais os dados, seria adequado um pouco de suavização, o que efetivamente "agruparia" os locais próximos. A abordagem mais simples seria usar uma função de estimativa de densidade do kernel (por exemplo, a função kde2d em R, embora possa ser necessário algum pré-processamento dos dados). Isso ajudaria a identificar "pontos quentes" na distribuição espacial e poderia levar um investigador a identificar os reservatórios ambientais de E. Coli.f(s)=E(prevumaeuence| yovocê umare Eun euocumatEuon s)

Dependendo dos outros dados que você possui, modelos espaciais mais sofisticados que se ajustam a fatores de confusão conhecidos podem ser usados.


Diagnosticar variantes EHEC e suas possíveis fontes parece difícil, duvidoso. Como você sabe, as autoridades alemãs disseram primeiro "são pepinos da Espanha" e, semanas depois, "definitivamente brotam" (sementes, água ...?) (Percebo que muitas pessoas querem uma resposta instantânea e recebem uma.) Com sintomas claros, um mapa pode levar a uma causa, como no famoso mapa do surto de cólera em Londres em 1854 . Mas mapa de surtos EHEC ?
Denis
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