Existe um pacote R (ou mesmo uma função R básica) que implementa o método de Fisher ou Stouffer para combinar valores-p? Codificar isso deve ser quase trivial, mas eu prefiro usar (e citar) um pacote.
Exemplo de código nesta pergunta: Método de Fisher para pentear valores-p - e a cauda inferior?
Respostas:
O metappacote de Michael Dewey implementa muitos métodos para combinar valores-p:
sumlog: Método de Fishersumz: Parece com o método de Stouffer (com pesos), isso não é mencionado explicitamente na documentação da função, mas confirmado na vinheta de rascunho (que ainda não faz parte do pacote)meanp: Ao combinar valores-p, por que não apenas calcular a média?Há também a combine.testfunção no survcomppacote (no biocondutor). Implementa o método de Fisher e Stouffer, bem como o método logit.
survcomptambém funciona no caso de borda de um único pvalue, lida com valores ausentes de maneira mais consistente com a base re incentiva contribuições fornecendo um repo oficial.