Em geral, nenhum deles é adequado. Os números inteiros são discretos , não contínuos, mas tratá-los como categorias nominais jogaria fora a maior parte da informação e até tratá-los como ordinais poderia perder um pouco.
Em algumas situações, uma ou outra pode estar bem, mas é quase sempre melhor tratá-las como elas são - por exemplo, se os dados forem importantes, use uma análise adequada para as contagens .
Como exemplo, suponha que você queira executar uma regressão nos dados da contagem; existem vários modelos de regressão de contagem, incluindo (mas não limitado a) Poisson, regressão binomial e binomial negativa.
No caso de IVs inteiros (preditores), não há mais necessidade de fazer nada com números inteiros do que de preditores contínuos - pelo menos não com base em que eles são inteiros.
No caso de preditores inteiros e preditivos contínuos, o ponto crítico é o seu entendimento (seja de teoria, estudos anteriores ou de algum outro meio) de como a variável preditora pode estar relacionada à resposta, e não ao fato de serem números inteiros.