O ponto de macro está correto: a maneira correta de comparar relações entre séries temporais é pela função de correlação cruzada (assumindo estacionariedade). Ter o mesmo comprimento não é essencial. A correlação cruzada no atraso 0 apenas calcula uma correlação como fazer a estimativa de correlação de Pearson emparelhando os dados nos pontos de tempo idênticos. Se eles tiverem o mesmo comprimento que você está assumindo, você terá pares T exatos onde T é o número de pontos no tempo para cada série. A correlação cruzada de atraso 1 corresponde ao tempo t da série 1 com o tempo t + 1 na série 2. Observe que, embora a série tenha o mesmo comprimento, você só possui um par T-2, pois um ponto da primeira série não tem correspondência na segunda. e um outro ponto da segunda série não terá correspondência da primeira. Dadas essas duas séries, é possível estimar a correlação cruzada em vários atrasos. Se alguma das correlações cruzadas for estatisticamente significativamente diferente de 0, indicará uma correlação entre as duas séries.