Atualmente, estou usando o pacote R lme4 .
Estou usando um modelo linear de efeitos mistos com efeitos aleatórios:
library(lme4)
mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects
mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect +
# random effects
mod3 <- lmer(r1 ~ p1 + p2 + (1 | site), data = sample_set) #Two fixed effects +
# random effects
Para comparar modelos, estou usando a anova
função e observando as diferenças na AIC em relação ao modelo mais baixo da AIC:
anova(mod1, mod2, mod3)
O acima é bom para comparar modelos.
No entanto, também preciso de uma maneira simples de interpretar medidas de qualidade de ajuste para cada modelo. Alguém tem experiência com essas medidas? Eu fiz algumas pesquisas e existem artigos de jornal em R ao quadrado para os efeitos fixos de modelos de efeitos mistos:
- Cheng, J., Edwards, LJ, Maldonado-Molina, MM, Komro, KA e Muller, KE (2010). Análise longitudinal real de dados para pessoas reais: construindo um modelo misto suficientemente bom. Statistics in Medicine, 29 (4), 504-520. doi: 10.1002 / sim.3775
- Edwards, LJ, Muller, KE, Wolfinger, RD, Qaqish, BF e Schabenberger, O. (2008). Uma estatística R2 para efeitos fixos no modelo linear misto. Statistics in Medicine, 27 (29), 6137-6157. doi: 10.1002 / sim.3429
Parece, no entanto, que há algumas críticas em torno do uso de medidas como as propostas nos documentos acima.
Alguém poderia sugerir algumas medidas fáceis de interpretar e de boa qualidade que poderiam ser aplicadas aos meus modelos?
mixed()
no meu pacote afex ( a versão de desenvolvimento também possui bootstrap paramétrico ). Veja aqui para algumas referências .
KRmodcomp
do pacote pbkrtest
. Você também pode usar KRmodcomp
diretamente para comparar modelos.