A hipótese nula não é equivalente a um anterior não informativo bayesiano pela simples razão de que os bayesianos também podem usar hipóteses nulas e realizar testes de hipóteses usando os fatores de Bayes. Se fossem equivalentes, os bayesianos não usariam hipóteses nulas.
No entanto, o teste de hipóteses freqüentista e bayesiano incorpora um elemento de auto-ceticismo, pois somos obrigados a mostrar que há alguma evidência de que nossa hipótese alternativa é de alguma forma uma explicação mais plausível para as observações do que o acaso. Os freqüentistas fazem isso tendo um nível de significância, os bayesianos fazem isso com uma escala de interpretação para o fator Bayes, de modo que não promulgaríamos fortemente uma hipótese, a menos que o fator Bayes sobre a hipótese nula fosse suficientemente alto.
Agora, a razão pela qual os testes de hipóteses freqüentistas são contra-intuitivos é porque um freqüentador não pode atribuir uma probabilidade não trivial à verdade de uma hipótese, que infelizmente é geralmente o que realmente queremos. O mais próximo que eles podem chegar disso é calcular o valor-p (a probabilidade das observações em H0) e, em seguida, tirar uma conclusão subjetiva sobre se H0 ou H1 são plausíveis. O bayesiano pode atribuir uma probabilidade à verdade de uma hipótese, e também pode determinar a razão dessas probabilidades para fornecer uma indicação de suas plausibilidades relativas, ou pelo menos de como as observações alteram a razão dessas probabilidades (que é o que Fator de Bayes sim).
Na minha opinião, é uma má idéia tentar aproximar demais os métodos freqüentes e bayesianos de teste de hipóteses, pois eles são fundamentalmente diferentes e respondem a perguntas fundamentalmente diferentes. Tratá-los como se fossem equivalentes incentiva uma interpretação bayesiana do teste freqüentista (por exemplo, a falácia do valor-p) que é potencialmente perigosa (por exemplo, céticos climáticos geralmente assumem que a falta de uma tendência estatisticamente significativa na temperatura média da superfície global significa que existe não houve aquecimento - o que não está correto).