Para não estatísticos como eu, é muito difícil capturar a ideia de VI
métrica (variação de informação) mesmo depois de ler o artigo relevante de Marina Melia " Comparando agrupamentos - uma distância baseada em informação " (Journal of Multivariate Analysis, 2007). De fato, não estou familiarizado com muitos dos termos dos agrupamentos por aí.
Abaixo está um MWE e eu gostaria de saber o que significa a saída nas diferentes métricas usadas. Eu tenho esses dois clusters em R e na mesma ordem de id:
> dput(a)
structure(c(4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 3L, 3L,
4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L,
1L, 1L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 2L, 2L,
4L, 3L, 3L, 2L, 2L, 2L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 1L, 4L, 3L, 4L, 4L,
4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 2L, 2L, 2L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L,
4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L,
4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 2L, 2L, 4L
), .Label = c("1", "2", "3", "4"), class = "factor")
> dput(b)
structure(c(4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 3L, 3L,
4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L,
1L, 1L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 2L, 2L,
4L, 3L, 3L, 2L, 2L, 2L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 1L, 4L, 3L, 4L, 4L,
3L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 2L, 2L, 2L, 4L, 3L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L,
4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 4L,
4L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 3L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 2L, 2L, 4L
), .Label = c("1", "2", "3", "4"), class = "factor")
Agora, fazendo comparações com base em VI
outras métricas / índices e em ordem cronológica de sua aparência na literatura.
library(igraph)
# Normalized Mutual Information (NMI) measure 2005:
compare(a, b, method = c("nmi"))
[1] 0.8673525
# Variation of Information (VI) metric 2003:
compare(a, b, method = c("vi"))
[1] 0.2451685
# Jaccard Index 2002:
clusteval::cluster_similarity(a, b, similarity = c("jaccard"), method = "independence")
[1] 0.8800522
# van Dongen S metric 2000:
compare(a, b, method = c("split.join"))
[1] 8
# Adjusted Rand Index 1985:
compare(a, b, method = c("adjusted.rand"))
[1] 0.8750403
# Rand Index 1971:
compare(a, b, method = c("rand"))
[1] 0.9374788
Como você pode ver, o VI
valor era diferente de todos os outros.
- O que esse valor diz (e como está relacionado à figura abaixo)?
- Quais são as diretrizes para considerar esse valor baixo ou alto?
- Existem diretrizes definidas?
Talvez os especialistas da área possam fornecer algumas descrições sensatas para leigos como eu ao tentar relatar esses resultados. Eu realmente apreciaria se alguém também fornecesse diretrizes para outras métricas (quando considerar o valor grande ou pequeno, isto é, em relação à semelhança entre dois clusters).
Eu li tópicos de CV relacionados aqui e aqui , mas ainda não consegui entender a intuição por trás VI
. Alguém pode explicar isso em inglês simples?
A figura abaixo é a figura 2 do documento mencionado acima VI
.