Esse escoamento que você está vendo provavelmente não é água, mas separação de gordura. Toque ou prove um pouco do líquido; se parece oleoso, então é gordo.
Ao fazer bolonhesa, se você não quer que isso aconteça, é necessário retirar frequentemente a gordura que sobe ao topo. Se você apenas voltar a mexer, ele se separará novamente mais tarde.
Você também deve cozinhá-lo lentamente (desnatando frequentemente) por boas 4 horas ou mais.
Devo observar que a gordura não é necessariamente má e alguns cozinheiros insistem que você nunca deve desnatá-lo, porque é aí que está o sabor. Pessoalmente, nunca encontrei muita diferença no sabor, se você roça ou não - mas se você não roça, o teor de gordura faz com que a mistura se separe mais tarde.
O mesmo acontece com o pimentão ou qualquer prato em que você esteja usando um mandril moído que ainda não teve toda a gordura removida pelo escurecimento profundo. Eventualmente, durante o cozimento, essa gordura deixará a carne e você precisará desnatá-la, cozinhá-la ou enfrentar a oleosidade.