Examinando suas perguntas em ordem:
A regra geral é a cebola primeiro. Refogue o alho no final por 30 segundos antes de retirar do fogo.
Como ElendilTheTall apontou corretamente, o alho pode queimar rapidamente, especialmente se você costuma refogar no lado quente (como eu). Iniciar o refogado com cebolas primeiro tem duas vantagens: permite controlar melhor o tempo que o alho gasta no calor e a umidade liberada pelas cebolas fornece um tipo de amortecedor do tipo de calor seco da panela refogada .
Tanto meu treinamento quanto minha experiência me levam a acreditar que não há vantagem concebível em colocar o alho em um refogado antes da cebola.
O tempo refogado para dar aquela mordida no alho cru certamente depende da maneira como o alho é preparado antes do refogado - a recomendação de 30 segundos que eu dei (1) acima seria para alho picado. Se você costuma usar pedaços ou fatias de alho, provavelmente precisará de mais tempo para refogar o alho - nesse caso, você ainda deve escolher primeiro a cebola, mas pode refogar mais tempo em fogo mais baixo para Certifique-se de que o alho tenha a chance de amadurecer antes de o exterior queimar.
Finalmente, como uma nota pessoal, a única vez em que incluo meu alho com a cebola é ao mesmo tempo em que refiro o pimentão com a cebola. Por causa de toda a umidade que é liberada entre os pimentões e as cebolas, acho que leva muito mais tempo para o alho cozinhar o suficiente, então deixo refogar com os amigos por vários minutos para suar.