Você precisa de uma faca mais afiada. Com uma faca cega, você terá problemas para atravessar a pele e acabará rasgando e esmagando, liberando muito suco. Com uma faca afiada, você passará pela pele de maneira limpa e deixará os tomates muito mais intactos.
Facas serrilhadas são outra opção comum: elas atravessam a pele com muita facilidade. Porém, uma faca serrilhada e maçante rasga muito a carne; portanto, você ainda precisa de uma lâmina razoavelmente afiada e, embora uma faca de pão barata ou uma faca de bife possa ser melhor do que nada, não é o ideal. Os melhores são provavelmente aqueles realmente comercializados como facas de tomate: são afiados, não muito grossos e têm um padrão de serrilhado destinado a isso.
Se você for forçado a se contentar com uma faca inadequada, poderá quebrar a pele com a ponta e estendê-la com a lâmina e cortar a partir daí. Se a faca é tão maçante que ainda faz uma bagunça, você pode estar sem sorte. Porém, isso consome muito tempo, então eu não sugeriria isso como um método diário para muitas fatias.
Congelar, como você sugeriu, não parece uma ótima idéia. Se você congelar os tomates completamente o suficiente para torná-los mais firmes e fáceis de cortar, então você formará muito gelo e, uma vez que descongelam, eles tendem a se desintegrar e liberar todo esse suco. Isso não afetará o sabor, mas é meio inútil, pois se você estiver disposto a bagunçar tanto a textura, é melhor cortá-la da maneira que quiser.