A coisa mais importante sobre ganhar massa muscular com um corpo magro ('tipo de corpo ectomorfo') é a dieta. Sua dieta deve ser altamente calórica e protéica; use uma calculadora de calorias on-line para calcular quanto você deve consumir por dia (o site de musculação geralmente tem alguns). Ao fixar sua dieta, tente obviamente consumir apenas produtos saudáveis, recomendo coisas como: ovos, leite, mingau, arroz integral, banana, queijo cottage e abacate, que tendem a ter uma alta contagem calórica ou protéica.
O melhor programa de condicionamento físico que eu recomendaria para quem está começando, seria o levantamento 5x5 - http://stronglifts.com/5x5/- . O que basicamente envolve ir à academia três vezes por semana e realizar três exercícios compostos - agachamento, supino, barra ou agachamento, supino e levantamento terra -.
Agora, com relação ao seu cotovelo, eu recomendaria consultar um médico ou, mais idealmente, um médico para ver se seu braço aguenta fisicamente a tensão desses exercícios; caso contrário, você pode fazer o seguinte para cada exercício:
Agachamento - eu recomendaria a versão do meio das costas, pois seus braços são necessários apenas para equilibrar a barra, portanto, não deve ser um problema, embora eu verifique apenas por precaução.
Levantamento terra - Você pode usar uma alça no ombro com o braço ruim para ajudar a aliviar a tensão ou procurar um amigo para ajudá-lo.
Supino de supino / supino - esse exercício pode não ser adequado se você não aguentar nenhum peso no braço ruim; no entanto, se você puder apenas tentar se estender o máximo possível e conseguir alguém para apoiá-lo, caso seu braço ceda.
Linha de barra - novamente pode não ser adequada se você não aguentar peso no braço. Se o seu braço não estiver totalmente estendido, inicie o exercício com os braços dobrados (não retos) e, em seguida, faça a amplitude de movimento a partir daí.
Espero que tenha ajudado, boa sorte.