Resultados conflitantes da soma dos quadrados do Tipo III na ANOVA no SAS e R


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Estou analisando dados de um experimento fatorial desequilibrado com SASe R. Ambos SASe Rfornecer semelhantes Tipo I soma dos quadrados, mas a sua soma Tipo III de quadrados são diferentes uns dos outros. Abaixo estão SASe Rcódigos e saídas.

DATA ASD;
INPUT Y T B;
DATALINES;
 20 1 1
 25 1 2
 26 1 2
 22 1 3
 25 1 3
 25 1 3
 26 2 1
 27 2 1
 22 2 2
 31 2 3
;

PROC GLM DATA=ASD;
CLASS T B;
MODEL Y=T|B;
RUN;

SS tipo I do SAS

Source  DF       Type I SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     17.06666667     17.06666667       9.75    0.0354
B       2     12.98000000      6.49000000       3.71    0.1227
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

SS tipo III do SAS

Source  DF     Type III SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     23.07692308     23.07692308      13.19    0.0221
B       2     31.05333333     15.52666667       8.87    0.0338
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

Código R

Y <- c(20, 25, 26, 22, 25, 25, 26, 27, 22, 31)
T <- factor(x=rep(c(1, 2), times=c(6, 4)))
B <- factor(x=rep(c(1, 2, 3, 1, 2, 3), times=c(1, 2, 3, 2, 1, 1)))
Data <- data.frame(Y, T, B)
Data.lm <- lm(Y~T*B, data = Data)
anova(Data.lm)
drop1(Data.lm,~.,test="F") 

SS tipo I de R

Analysis of Variance Table

Response: Y
          Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
T          1 17.067  17.067  9.7524 0.03543 *
B          2 12.980   6.490  3.7086 0.12275  
T:B        2 47.853  23.927 13.6724 0.01629 *
Residuals  4  7.000   1.750                  
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

SS tipo III de R

Single term deletions

Model:
Y ~ T * B
       Df Sum of Sq    RSS     AIC F value  Pr(>F)  
<none>               7.000  8.4333                  
T       1    28.167 35.167 22.5751 16.0952 0.01597 *
B       2    20.333 27.333 18.0552  5.8095 0.06559 .
T:B     2    47.853 54.853 25.0208 13.6724 0.01629 *
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

Estou faltando alguma coisa aqui? Se não, qual é o correto tipo III SS?


Respostas:


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SS tipo III dependem da parametrização utilizada. Se eu definir

  options(contrasts=c("contr.sum","contr.poly"))

antes de executar lm()e, em seguida drop1(), recebo exatamente o mesmo SS do tipo III que o SAS. Para o dogma da comunidade R sobre esse assunto, você deve ler as Exegeses de Venables sobre modelos lineares .

Veja também: Como fazer uma ANOVA SS de Tipo III em R com códigos de contraste?


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@ Peter Se você acha que pode caber em um comentário, por que não. Eu acho que não, então por que não fazer uma nova pergunta (e link para esta)?
— 20442 chl

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@chl Meu básica ponto é que os efeitos principais que têm significado na presença de interações - eles são o efeito quando a outra variável é 0. Muitas vezes isso é significativo. Não tenho certeza se vale a pena uma discussão inteira.
— Peter Flom - Restabelece Monica

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Concordo que há situações em que os principais efeitos podem ser interpretados - Venables segue uma linha muito forte -, mas há muitas situações em que são difíceis. Eu acho que "não faça isso se você não sabe o que está fazendo" é uma configuração padrão razoável ...
— Ben Bolker

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O seguinte redefinirá os contrastes para o padrão R? options(contrasts=c("contr.treatment", "contr.poly"))
— Rasmus Larsen

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Sim ...........
— Ben Bolker
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