Perguntas com a marcação «parallel-computing»

Estou paralelizando código para resolver numericamente um modelo de equilíbrio populacional em 5 dimensões. Atualmente, tenho um código paralelo MPICH2 muito bom no FORTRAN, mas à medida que aumentamos os valores dos parâmetros, as matrizes ficam muito grandes para serem executadas no modo de memória distribuída. Eu tenho acesso a …

14 parallel-computing  fortran  numerics  mpi  compiling 

Na solução numérica dos PDEs de valor-limite inicial, é muito comum empregar paralelismo no espaço . É muito menos comum empregar alguma forma de paralelismo na discretização do tempo , e esse paralelismo é geralmente muito mais limitado. Estou ciente de um número crescente de códigos e trabalhos publicados que …

14 pde  parallel-computing  time-integration 

Normalmente, escrevo código serial e, quando o faço, escrevo testes de unidade com alguma estrutura de teste no estilo xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose ou estrutura de teste C ++ do Google). Com base em uma pesquisa superficial do Google, não tenho visto muito sobre como os profissionais praticam …

13 parallel-computing  petsc  mpi  testing  reproducibility 

Eu tenho uma coleção de modelos computacionais que podem ser descritos como autômatos celulares assíncronos. Esses modelos se assemelham ao modelo de Ising, mas são um pouco mais complicados. Parece que esses modelos se beneficiariam de serem executados em uma GPU, e não em uma CPU. Infelizmente, não é muito …

12 parallel-computing  monte-carlo  gpu 

Atualmente, estou desenvolvendo um método de decomposição de domínio para a solução do problema de espalhamento. Basicamente, estou resolvendo um sistema de Helmholtz BVPs iterativamente. Discreto as equações usando o método dos elementos finitos sobre malhas triangulares ou tetraédricas. Estou desenvolvendo o código para minha tese de doutorado. Estou ciente …

11 finite-element  parallel-computing  mesh-generation  domain-decomposition  mesh 

Olá comunidade scicomp, Trabalhei na área de algoritmos de grafos usando frameworks como NetworkX (Python), JUNG e YFiles (Java). Agora estou entrando na área da computação paralela e de alto desempenho. Para um novo projeto, estou procurando uma biblioteca de gráficos C ++ com os seguintes recursos: possui uma interface …

11 algorithms  parallel-computing  libraries  graph-theory 

Tenho experiência em codificar OpenMP para máquinas de memória compartilhada (em C e FORTRAN) para realizar tarefas simples como adição de matriz, multiplicação etc. (Apenas para ver como ele compete com o LAPACK). Conheço o OpenMP o suficiente para realizar tarefas simples sem a necessidade de consultar a documentação. Recentemente, …

11 parallel-computing  python 

Pelo que entendi, o método multigrid resolve um sistema linear, resolvendo uma versão mais grossa do mesmo problema (eliminando o erro de baixa frequência) e projetando-se de volta à grade fina para suavizar os erros de alta frequência. Para sistemas grandes, posso ver como um método iterativo pode ser implementado …

11 linear-algebra  parallel-computing  multigrid 

Simultaneamente à minha pesquisa sobre os métodos do subespaço de Krylov, tenho a opção de explorar a matemática por trás do HPC um passo à frente ou a teoria da computação (hardware, SO, compiladores etc.). Atualmente, eu sei que tanto o suficiente para apenas sobreviver. Por exemplo, eu sei como …

11 parallel-computing  education 

Os algoritmos Parareal, PITA e PFASST são técnicas de todo o domínio para paralelizar a solução de problemas dependentes do tempo no tempo. Quais são os princípios orientadores por trás desses métodos? Quais são as principais diferenças entre eles? Posso dizer que um é baseado no outro? Como? E as …

10 parallel-computing  time-integration 

Estou procurando portar algum código que resolva um conjunto de equações diferenciais parciais (PDE) pelo método de volume finito no formato IMPLICIT (para discretização do tempo). Como resultado, existe um sistema tridiagonal de equações nas direções x, y, z, que é tratado pelo esquema ADI / TDMA. Não consigo encontrar …

10 parallel-computing  implicit-methods  cuda 

Atualmente, estou trabalhando na solução de sistemas simétricos muito grandes (mas não positivos definidos), gerados por alguns algoritmos. Essas matrizes têm uma boa esparsidade de bloco que pode ser usada para solução paralela. Mas não consigo decidir se devo usar uma abordagem direta (como Multi-frontal) ou iterativa (GMRES ou MINRES). …

10 parallel-computing  linear-solver  sparse-matrix  linear-system  gmres 

Nos últimos anos, surgiram várias bibliotecas / projetos de software que oferecem uma forma ou outra de paralelismo de memória compartilhada de uso geral orientado a dados. A idéia principal é que, em vez de escrever um código explicitamente encadeado, os programadores implementam seus algoritmos como tarefas interdependentes, que são …

10 parallel-computing  software  hpc  libraries  multicore 

Eu sou muito novo na programação GPGPU, então, desculpe-me se a pergunta não for particularmente apropriada. Pelo que entendi, a programação da GPU é um trabalho muito complicado de engenharia, quando comparado à programação usual da CPU. É preciso ter muito cuidado com questões de divergência, lado a lado, alocação …

10 parallel-computing  petsc  gpu  cuda 

Estou tentando diagonalizar algumas matrizes densas e mal condicionadas. Na precisão da máquina, os resultados são imprecisos (retornando valores próprios negativos, os vetores próprios não possuem as simetrias esperadas). Eu mudei para a função Eigensystem [] do Mathematica para tirar proveito da precisão arbitrária, mas os cálculos são extremamente lentos. …

10 linear-algebra  parallel-computing  eigensystem  precision  dense-matrix