Perguntas com a marcação «lme4-nlme»

Fechadas. Esta questão está fora de tópico . No momento, não está aceitando respostas. Deseja melhorar esta pergunta? Atualize a pergunta para que ela esteja no tópico de Validação cruzada. Fechado há 6 meses . Eu estava trabalhando nos pacotes R nlme e lme4 , tentando especificar os modelos com …

25 r  random-effects-model  lme4-nlme 

Estou tentando deixar de usar o ezpacote lmepara medidas repetidas ANOVA (como espero poder usar contrastes personalizados lme). Seguindo o conselho desta postagem no blog, consegui configurar o mesmo modelo usando os dois aov(como faz ez, quando solicitado) e lme. No entanto, enquanto no exemplo dado nesse post os valores …

24 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Eu estive examinando essa visão geral das fórmulas lm / lmer R por @conjugateprior e fiquei confuso com a seguinte entrada: Agora assuma que A é aleatório, mas B é fixo e B está aninhado em A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Abaixo, a fórmula do modelo misto análogo …

23 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Gostaria de saber se existem métodos para calcular o tamanho da amostra em modelos mistos? Estou usando lmerno R para ajustar os modelos (tenho inclinações e interceptações aleatórias).

23 r  mixed-model  lme4-nlme  power-analysis 

Executamos uma regressão logística de efeitos mistos usando a seguinte sintaxe; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Assunto e Item são os efeitos aleatórios. Estamos obtendo um resultado ímpar, que é o coeficiente e …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Suponha que eu tenha alguma medida para cada assunto em cada site. Duas variáveis, assunto e site, são de interesse em termos de computação de valores de correlação intraclasse (ICC). Normalmente eu usaria a função lmerdo pacote R lme4e executava lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | …

22 r  lme4-nlme  intraclass-correlation 

Tenho um experimento de medidas repetidas em que a variável dependente é uma porcentagem e tenho vários fatores como variáveis ​​independentes. Eu gostaria de usar glmero pacote R lme4para tratá-lo como um problema de regressão logística (especificando family=binomial), pois parece acomodar essa configuração diretamente. Meus dados são assim: > head(data.xvsy) …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Com o seguinte conjunto de dados, eu queria ver se a resposta (efeito) muda em relação a sites, temporada, duração e suas interações. Alguns fóruns on-line sobre estatísticas sugeriram que eu continuasse com os Modelos de efeitos mistos lineares, mas o problema é que, como as réplicas são randomizadas em …

21 r  mixed-model  lme4-nlme 

Eu tenho trabalhado com alguns dados que têm alguns problemas com medições repetidas. Ao fazer isso, notei um comportamento muito diferente entre lme()e lmer()usando meus dados de teste e quero saber o porquê. O conjunto de dados falsos que criei possui medidas de altura e peso para 10 indivíduos, tiradas …

20 r  mixed-model  lme4-nlme 

Eu estive analisando a modelagem de efeitos mistos usando o pacote lme4 em R. Estou usando principalmente o lmercomando, por isso vou fazer minha pergunta por meio de código que usa essa sintaxe. Suponho que possa ser uma pergunta fácil geral, é correto comparar dois modelos construídos no lmeruso de …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Sabemos que um teste t emparelhado é apenas um caso especial de ANOVA unidirecional de medidas repetidas (ou dentro do sujeito), bem como modelo linear de efeitos mistos, que pode ser demonstrado com a função lme (), o pacote nlme em R como mostrado abaixo. #response data from 10 subjects …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Considere os seguintes dados de uma maneira bidirecional no design de assuntos: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Digamos que precisamos dos GLMMs mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Esses modelos não são aninhados no sentido usual de: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Digamos que estamos trabalhando em um modelo de efeitos aleatórios de alguns dados de contagem ao longo do tempo e queremos controlar algumas tendências. Normalmente, você faria algo como: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") para incluir uma forma quadrática para t. É possível usar algumas técnicas de suavização mais …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Há uma distinção que está me atrapalhando com modelos mistos, e eu estou me perguntando se eu poderia ter alguma clareza sobre isso. Vamos supor que você tenha um modelo misto de dados de contagem. Há uma variável que você sabe que deseja como efeito fixo (A) e outra variável …

19 r  mixed-model  lme4-nlme