Ciência computacional

Perguntas e respostas para cientistas que usam computadores para resolver problemas científicos


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Métodos Numéricos para a Equação de Schrodinger
Estamos comparando o desempenho de vários métodos numéricos que podem ser usados ​​para resolver a Equação de Schrodinger para o átomo de hidrogênio interagindo com um forte pulso de laser (forte demais para usar métodos de perturbação). Ao usar esquemas de discretização para a parte radial, parece que a maioria …

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Resolvendo um problema de mínimos quadrados com restrições lineares em Python
Eu preciso resolver s.t.minx∥Ax−b∥22,∑ixi=1,xi≥0,∀i.minx‖Ax−b‖22,s.t.∑ixi=1,xi≥0,∀i.\begin{alignat}{1} & \min_{x}\|Ax - b\|^2_{2}, \\ \mathrm{s.t.} & \quad\sum_{i}x_{i} = 1, \\ & \quad x_{i} \geq 0, \quad \forall{i}. \end{alignat} Eu acho que é um problema quadrático que deve ser solucionado com o CVXOPT , mas não sei como.

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Custos de pesquisas versus cálculos
Estou interessado em estabelecer cálculos para verificar se um critério de distância é atendido: ou seja, a distância entre um vetor vetor x j deve ser menor que algum valor r m a x . Meus dados são particionados de acordo com uma grade ortogonal de coordenadas. Como meu ponto …
12 efficiency 

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Métodos de decomposição para resolver grandes problemas de otimização
Fiquei imaginando se alguém teria alguma sugestão de textos ou artigos de pesquisa sobre métodos de decomposição (por exemplo, decomposições primal, dupla, Dantzig-Wolfe) para resolver grandes problemas de programação matemática. Gostei das "Notas sobre métodos de decomposição" , de Stephen Boyd , e seria ótimo encontrar, por exemplo, um livro …


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Biblioteca de álgebra linear do Blaze?
O artigo "Modelos de Expressão Revisitados: Uma Análise de Desempenho das Metodologias Atuais" no SIAM Journal of Scientific Computing faz referência à biblioteca de álgebra linear "Blaze". Eu nunca ouvi falar disso antes e não consigo encontrar referências on-line. (As pesquisas óbvias no Google estão devolvendo o artigo acima.) Então, …


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Criando um editor / visualizador molecular: Programação orientada a objetos, estruturas de dados e moléculas
Eu sou novo em programação e estou tentando resolver meu primeiro grande problema e escrever meu primeiro grande programa. Procurei exemplos de código-fonte aberto para aprender, mas até agora encontrei o código em idiomas que não entendo completamente ou que fazem coisas relacionadas, mas ainda muito distantes, para eu realmente …

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Enumeração de gráficos derivados de mosaicos de Delaunay em 3D
Existe um algoritmo que enumera os gráficos que correspondem a algum mosaico de pontos de Delaunay em 3D? Em caso afirmativo, existe uma parametrização eficiente de geometrias que correspondem a qualquer "gráfico de Delaunay"? Eu estou procurando enumerar sistematicamente todas as geometrias estáveis ​​de moléculas de uma composição especificada sem …





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Escalabilidade da Transformada Rápida de Fourier (FFT)
Para usar a Fast Fourier Transform (FFT) em dados de amostra uniforme, por exemplo, em conexão com os solucionadores de PDE, é sabido que a FFT é um algoritmo ). Quão bem a escala FFT é processada em paralelo para (isto é, muito grande)?n → ∞O (nlog( N )O(nlog⁡(n)\mathcal{O}(n\log(n)n → …

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