Perguntas com a marcação «parallel-computing»

Estou pensando em aprender uma nova linguagem para usar em projetos de modelagem numérica / simulação, como uma substituição (parcial) para o C ++ e Python que atualmente uso. Me deparei com Julia , o que parece perfeito. Se ele fizer tudo o que afirma, eu poderia usá-lo para substituir …

55 parallel-computing  languages  julia 

Atualmente, estou procurando métodos paralelos para integração com ODE. Há muita literatura nova e antiga por aí descrevendo uma ampla variedade de abordagens, mas não encontrei nenhuma pesquisa recente ou artigo de visão geral descrevendo o tópico em geral. Existe o livro de Burrage [1], mas tem quase 20 anos …

39 parallel-computing  ode  numerical-analysis 

Estou procurando informações de qualquer pessoa que tenha tentado usar o OpenCL em seu código científico. Alguém já tentou (recentemente) o ViennaCL ? Em caso afirmativo, como ele se compara à cúspide ? E o OCLTools ? Isso faz jus à promessa? Nesse caso, seria uma maneira viável de começar …

35 parallel-computing  libraries  programming-paradigms  viennacl  opencl 

Existem ferramentas no Python que são como o parfor do Matlab? Encontrei este tópico , mas tem quatro anos. Eu pensei que talvez alguém aqui possa ter uma experiência mais recente. Aqui está um exemplo do tipo de coisa que eu gostaria de paralelizar: X = np.random.normal(size=(10, 3)) F = …

35 python  parallel-computing 

Esta pergunta foi migrada do Stack Overflow porque pode ser respondida no Computational Science Stack Exchange. Migrou há 7 anos . Existem problemas / algoritmos famosos na computação científica que não podem ser acelerados pela paralelização? Parece-me ao ler livros sobre CUDA que a maioria das coisas pode ser.

27 parallel-computing 

Como o problema gravitacional do corpo-n pode ser resolvido numericamente em paralelo? É possível compensar a complexidade da precisão? Como a precisão influencia a qualidade do modelo?

25 algorithms  ode  parallel-computing  complexity  precision 

Não estou executando nenhum código paralelo agora, mas prevejo a execução de código paralelo no futuro usando um híbrido de OpenMP e MPI. Depuradores foram ferramentas inestimáveis ​​para mim ao executar projetos em série. Alguém pode recomendar um depurador paralelo (ou vários depuradores) para usar na depuração de software paralelo? …

24 software  parallel-computing 

Eu tenho um aplicativo que pode ser trivialmente paralelizado, mas seu desempenho é em grande parte limitado a E / S. O aplicativo lê uma única matriz de entrada armazenada em um arquivo com tamanho geralmente de 2 a 5 GB (mas espero que esse número aumente no futuro). Um …

20 io  parallel-computing  mpi 

Deseja melhorar este post? Forneça respostas detalhadas para esta pergunta, incluindo citações e uma explicação de por que sua resposta está correta. Respostas sem detalhes suficientes podem ser editadas ou excluídas. Refinamento de malha adaptável (AMR) é uma técnica comum para lidar com o problema de escalas espaciais muito variadas …

18 pde  libraries  parallel-computing  adaptive-mesh-refinement 

Muito do meu trabalho gira em torno de melhorar a escala dos algoritmos, e uma das maneiras preferidas de mostrar escala paralela e / ou eficiência paralela é traçar o desempenho de um algoritmo / código sobre o número de núcleos, por exemplo, onde o eixo representa o número de …

17 parallel-computing  hpc  scaling  plotting 

Uma redução paralela assume que a operação correspondente é associativa. Essa suposição é violada pela adição de números de ponto flutuante. Você pode perguntar por que eu me importo com isso. Bem, isso torna os resultados menos reproduzíveis. E fica pior quando o recozimento simulado é usado para otimizar (ou …

17 parallel-computing  reproducibility 

Minha tese é sobre o desenvolvimento de métodos numéricos para redução de modelos na combustão. Eu executo meus métodos puramente na parte química das simulações de combustão e tenho muitos estudos de caso para simulações 0-D (sem fluxo). O que eu gostaria é executar simulações que tenham fluxo nelas, preferencialmente …

17 pde  fluid-dynamics  software  parallel-computing 

Estou otimizando uma função de 10 a 20 variáveis. A má notícia é que cada avaliação de função é cara, aproximadamente 30 min de computação em série. A boa notícia é que tenho um cluster com algumas dúzias de nós computacionais à minha disposição. Assim, a pergunta: existem algoritmos de …

15 optimization  parallel-computing 

Estou executando simulações de dinâmica molecular (MD) usando vários pacotes de software, como Gromacs e DL_POLY. O Gromacs agora suporta os algoritmos de decomposição de partículas e de domínio. Por padrão, as simulações do Gromacs usam a decomposição de domínio, embora por muitos anos, até recentemente, a decomposição de partículas …

15 parallel-computing  efficiency  molecular-dynamics  simulation 

Desculpe pelo longo post, mas eu queria incluir tudo o que achava relevante desde o início. O que eu quero Estou implementando uma versão paralela dos métodos de subespaço de Krylov para matrizes densas. Principalmente GMRES, QMR e CG. Percebi (após a criação de perfil) que minha rotina DGEMV era …

15 parallel-computing  matrix  lapack  blas