Perguntas com a marcação «r»

Estou pensando em construir interfaces MATLAB e R para Ross Quinlan 's C5.0 (para aqueles que não estão familiarizados com ele, C5.0 é um pacote de algoritmo de árvore de decisão e software; uma extensão de C4.5 ), e eu estou tentando ter uma idéia dos componentes que eu precisaria …

10 r  machine-learning  matlab 

Existe uma maneira de plotar a linha de regressão de um modelo por partes assim, além de usar linespara plotar cada segmento separadamente ou usar geom_smooth(aes(group=Ind), method="lm", fill=FALSE)? m.sqft <- mean(sqft) model <- lm(price~sqft+I((sqft-m.sqft)*Ind)) # sqft, price: continuous variables, Ind: if sqft>mean(sqft) then 1 else 0 plot(sqft,price) abline(reg = model) …

10 r  data-visualization  regression 

Eu tenho um conjunto de dados com muitos zeros que se parece com isso: set.seed(1) x <- c(rlnorm(100),rep(0,50)) hist(x,probability=TRUE,breaks = 25) Gostaria de desenhar uma linha para sua densidade, mas a density()função usa uma janela em movimento que calcula valores negativos de x. lines(density(x), col = 'grey') Há density(... from, …

10 r  probability  kde 

Estou ajustando um modelo linear em R usando glmnet. O modelo original (não regularizado) foi ajustado usando lme não tinha um termo constante (ou seja, estava na forma lm(y~0+x1+x2,data)). glmnetleva uma matriz de preditores e um vetor de respostas. Eu tenho lido a glmnetdocumentação e não encontro menção ao termo …

10 r  regression  lasso 

Querendo saber se alguém já se deparou com um pacote / função em R que combinará níveis de um fator cuja proporção de todos os níveis de um fator seja menor que algum limite? Especificamente, uma das primeiras etapas na preparação de dados que eu conduzo é recolher níveis esparsos …

10 r  many-categories 

Fechadas. Esta questão está fora de tópico . No momento, não está aceitando respostas. Deseja melhorar esta pergunta? Atualize a pergunta para que ela esteja no tópico de Validação cruzada. Fechado há 2 anos . Eu gostaria de aprender a usar o Rcpp . Analisei os documentos no site CRAN …

10 r  c++ 

Se alguém estiver testando a suposição de homoscedasticidade, os testes paramétricos (Teste de Homogeneidade de Variâncias de Bartlett bartlett.test) e não paramétricos (Teste de Homogeneidade de Variâncias de Figner-Killeen fligner.test) estão disponíveis. Como saber qual tipo usar? Isso deve depender, por exemplo, da normalidade dos dados?

10 r  variance  heteroscedasticity  misspecification 

Estou examinando alguns dados de cobertura genômica, que são basicamente uma longa lista (alguns milhões de valores) de números inteiros, cada um dizendo quão bem (ou "profunda") essa posição no genoma é coberta. Gostaria de procurar "vales" nesses dados, ou seja, regiões que são significativamente "mais baixas" do que o …

10 r  distributions  statistical-significance  data-visualization 

Preciso analisar com R os dados de uma pesquisa médica (com mais de 100 colunas codificadas) que vem em um CSV. Vou usar chocalho para algumas análises iniciais, mas nos bastidores ainda é R. Se eu ler o arquivo.csv () , as colunas com códigos numéricos serão tratadas como dados …

10 r  categorical-data  data-transformation 

Eu tenho um conjunto de dados com colunas a b c(3 atributos). aé numérico e contínuo enquanto be csão categóricos, cada um com dois níveis. Eu estou usando o método Vizinhos K-Nearest to classificar ae bon c. Portanto, para poder medir as distâncias, eu transformo meu conjunto de dados removendo …

10 r  classification  k-nearest-neighbour 

Esta é mais uma pergunta conceitual, mas como eu uso R, vou me referir aos pacotes em R. Se o objetivo é ajustar um modelo linear para fins de previsão e, em seguida, fazer previsões onde os efeitos aleatórios podem não estar disponíveis, existe algum benefício em usar um modelo …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

"Resíduos estudantis" e "resíduos padronizados" são os mesmos nos modelos de regressão? Eu construí um modelo de regressão linear em R e queria plotar o gráfico de resíduos Studentized v / s valores ajustados, mas não encontrei uma maneira automatizada de fazer isso em R. Suponha que eu tenho um …

10 r  regression  residuals  terminology 

Situação: Dois pássaros (machos e fêmeas) protegem seus ovos no ninho contra um intruso. Cada ave pode usar ataque ou ameaça para proteção e estar presente ou ausente. Existe um padrão emergente nos dados de que o comportamento pode ser complementar - ataques masculinos enquanto as mulheres usam ameaças e …

10 r  sequence-analysis 

Carregue o pacote necessário. library(ggplot2) library(MASS) Gere 10.000 números ajustados à distribuição gama. x <- round(rgamma(100000,shape = 2,rate = 0.2),1) x <- x[which(x>0)] Desenhe a função densidade de probabilidade, supondo que não sabemos em qual distribuição x se encaixa. t1 <- as.data.frame(table(x)) names(t1) <- c("x","y") t1 <- transform(t1,x=as.numeric(as.character(x))) t1$y <- …

10 r  mathematical-statistics  goodness-of-fit  gamma-distribution  ggplot2 

Contexto Estou tentando entender como o coxph (R) aceita e lida com entradas repetidas para assuntos (ou paciente / cliente, se você preferir). Alguns chamam isso de formato longo, outros chamam de 'medidas repetidas'. Veja, por exemplo, o conjunto de dados que inclui a coluna ID na seção Respostas em: …

10 r  repeated-measures  survival  cox-model  frailty