Perguntas com a marcação «sequence-analysis»

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Enquadrando a distribuição binomial negativa para sequenciamento de DNA
A distribuição binomial negativa tornou-se um modelo popular para dados de contagem (especificamente o número esperado de leituras de seqüenciamento dentro de uma determinada região do genoma de um determinado experimento) em bioinformática. As explicações variam: Alguns o explicam como algo que funciona como a distribuição de Poisson, mas tem …
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Por que Anova () e drop1 () forneceram respostas diferentes para os GLMMs?
Eu tenho um GLMM do formulário: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Quando uso drop1(model, test="Chi"), obtenho resultados diferentes dos que utilizo Anova(model, type="III")na embalagem do carro ou summary(model). Estes dois últimos dão as mesmas respostas. Usando um monte de dados fabricados, …
10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 
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Como provar a cooperação de sequências comportamentais
Situação: Dois pássaros (machos e fêmeas) protegem seus ovos no ninho contra um intruso. Cada ave pode usar ataque ou ameaça para proteção e estar presente ou ausente. Existe um padrão emergente nos dados de que o comportamento pode ser complementar - ataques masculinos enquanto as mulheres usam ameaças e …
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Identificando padrões sequenciais
Estou trabalhando com dados de sequência, que são longas listas de chamadas win-api de malware. Estou tentando converter o problema de identificar 'comportamento de malware' em um dos padrões sequenciais. Trato cada chamada da API como um único item Itemset. O número de diferentes itens possíveis (chamadas da API) é …
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