Ciência computacional

Esta pergunta foi migrada do Mathematics Stack Exchange porque pode ser respondida no Computational Science Stack Exchange. Migrou há 6 anos . Estou prestes a começar a trabalhar em uma biblioteca de software de solucionadores numéricos de ODE e estou tendo dificuldades em formular testes para as implementações do solucionador. …

26 ode 

Existem ferramentas projetadas especificamente para compactar dados científicos de ponto flutuante? Se uma função é suave, obviamente há muita correlação entre os números que representam essa função; portanto, os dados devem ser compactados bem. Compactar / compactar dados binários de ponto flutuante não o compacta tão bem. Gostaria de saber …

26 data-storage 

Os desenvolvedores de software têm a opção de escolher uma licença apropriada de acordo com o (s) objetivo (s) do trabalho. Alguém pode dar algumas recomendações / experiências sobre qual licença escolher para o software? Quais são os prós / contras de "doar" todo o trabalho codificado como códigos de …

26 software 

O que é um algoritmo simples para calcular o SVD de matrizes?2×22×22 \times 2 Idealmente, eu gostaria de um algoritmo numericamente robusto, mas gostaria de ver implementações simples e não tão simples. Código C aceito. Alguma referência a documentos ou código?

26 linear-algebra  matrix  reference-request  svd  matrix-factorization 

O que pode dar errado ao usar métodos Krylov pré-condicionados da KSP ( pacote de solucionadores lineares do PETSc ) para resolver um sistema linear esparso, como os obtidos pela discretização e linearização de equações diferenciais parciais? Que etapas posso tomar para determinar o que está errado com o meu …

26 linear-algebra  petsc  preconditioning  krylov-method  iterative-method 

Pergunta relacionada: Estado do Mac OS em Computação Científica e HPC Um número significativo de pacotes de software em ciência da computação são escritos no Fortran, e o Fortran não está indo embora. Um compilador Fortran também é necessário para criar outros pacotes de software (um exemplo notável é o …

25 software  fortran 

Estou procurando uma ferramenta para visualizar gráficos de links direcionais muito grandes. Atualmente, tenho ~ 2 milhões de nós com bordas de ~ 10 milhões. Eu tentei algumas coisas diferentes, mas a maioria leva horas para fazer gráficos de 100k nós O que eu tentei: passei um dia com gephi, …

25 visualization 

Que considerações devo fazer ao escolher entre BFGS e gradiente conjugado para otimização? A função que estou tentando ajustar com essas variáveis ​​são funções exponenciais; no entanto, a função objetivo real envolve integração, entre outras coisas, e é muito dispendiosa se isso ajudar.

25 optimization  conjugate-gradient 

Preciso avaliar numericamente a integral abaixo: ∫∞0 0s i n c′( x r ) r E( r )----√dr∫0∞sinc′(xr)rE(r)dr\int_0^\infty \mathrm{sinc}'(xr) r \sqrt{E(r)} dr onde , e . Aqui é a função de Bessel modificada do segundo tipo. No meu caso particular, tenho , e .x∈R+λ,κ,ν>0Kλ=0,00313κ=0,00825ν=0,33E( r ) = r4( λ κ2+ …

25 matlab  quadrature  special-functions 

Dada uma função real de variáveis ​​reais, existe um software disponível que possa gerar automaticamente código com precisão numérica para calcular a função em todas as entradas em uma máquina equipada com aritmética IEEE 754? Por exemplo, se a função real a ser avaliada fosse: O software consideraria o cancelamento …

25 software  floating-point  accuracy 

Como o problema gravitacional do corpo-n pode ser resolvido numericamente em paralelo? É possível compensar a complexidade da precisão? Como a precisão influencia a qualidade do modelo?

25 algorithms  ode  parallel-computing  complexity  precision 

Neste comentário eu escrevi: ... integrador SciPy padrão, que suponho usar apenas métodos simpléticos. no qual estou me referindo ao SciPy's odeint, que usa um "método não rígido (Adams)" ou um "método rígido (BDF)". Segundo a fonte : def odeint(func, y0, t, args=(), Dfun=None, col_deriv=0, full_output=0, ml=None, mu=None, rtol=None, atol=None, …

25 ode  time-integration  integration  differential-equations 

Não entendo o comportamento diferente da equação de advecção-difusão quando aplico diferentes condições de contorno. Minha motivação é a simulação de uma quantidade física real (densidade de partículas) sob difusão e advecção. A densidade de partículas deve ser conservada no interior, a menos que saia pelas bordas. Por essa lógica, …

25 pde  boundary-conditions  advection  diffusion  crank-nicolson 

De um modo geral, ouvi analistas numéricos opinarem que "Claro, matematicamente falando, o tempo é apenas outra dimensão, mas ainda assim, o tempo é especial" Como justificar isso? Em que sentido o tempo é especial para a ciência computacional? Além disso, por que tantas vezes preferimos usar diferenças finitas (levando …

24 pde  discretization 

Suponha que eu esteja trabalhando em um código científico em C ++. Em uma discussão recente com um colega, foi argumentado que os modelos de expressão poderiam ser uma coisa muito ruim, potencialmente tornando o software compilável apenas em determinadas versões do gcc. Supostamente, esse problema afetou alguns códigos científicos, …

24 performance  c++  automatic-differentiation  interval-arithmetic