Perguntas com a marcação «mixed-model»

Estou trabalhando em um conjunto de dados para avaliar o impacto da secagem nas atividades microbianas dos sedimentos. O objetivo é determinar se o impacto da secagem varia entre os tipos e / ou profundidade dos sedimentos. O projeto experimental é o seguinte: O primeiro fator Sedimento corresponde a três …

11 mixed-model  interaction  post-hoc  lme4-nlme 

Recentemente me disseram que não era possível incorporar covariáveis ​​variáveis ​​no tempo em modelos mistos longitudinais sem introduzir um intervalo de tempo para essas covariáveis. Você pode confirmar / negar isso? Você tem alguma referência sobre esta situação? Proponho uma situação simples para esclarecer. Suponha que eu tenha repetido medidas …

11 r  mixed-model  lme4-nlme 

Estou tentando reproduzir vários testes de interação entre ambos lme lmerem medidas repetidas (2x2x2). O motivo pelo qual desejo comparar os dois métodos é porque o GLM do SPSS para medidas repetidas produz exatamente os mesmos resultados da lmabordagem apresentada aqui, então, no final, quero comparar o SPSS vs o …

10 anova  mixed-model  lme4-nlme  repeated-measures  lm 

Estou tentando calcular manualmente as previsões de efeitos aleatórios a partir de um modelo misto linear e usando a notação fornecida por Wood em Modelos Aditivos Generalizados: uma introdução ao R (página 294 / página 307 do pdf), estou ficando confuso sobre o que cada parâmetro representa. Abaixo está um …

10 mixed-model  lme4-nlme 

Como contrapartida deste post , trabalhei na simulação de dados com variáveis ​​contínuas, prestando-se a interceptações e declives correlacionados. Embora existam ótimas postagens sobre esse tópico no site e fora dele , tive dificuldades em encontrar um exemplo do começo ao fim com dados simulados que se assemelhavam a um …

10 regression  mixed-model  lme4-nlme 

Na lmerfunção dentro lme4de Rhá uma chamada para a construção de uma matriz modelo de efeitos aleatórios, ZZZ , como explicado aqui , páginas 7 - 9. O cálculo de ZZZ envolve produtos KhatriRao e / ou Kronecker de duas matrizes, JEuJEuJ_i e XEuXEuX_i . A matriz de JEuJEuJ_i é …

10 r  mixed-model  lme4-nlme  matrix 

Estou realizando testes post-hoc em um modelo linear de efeitos mistos em R( lme4pacote). Estou usando o multcomppacote ( glht()função) para executar os testes post-hoc. Meu projeto experimental é de medidas repetidas, com um efeito de bloqueio aleatório. Os modelos são especificados como: mymod <- lmer(variable ~ treatment * time …

10 mixed-model  post-hoc  lsmeans  lme4-nlme 

Dadas três variáveis, ye x, que são positivas contínuas e z, que são categóricas, tenho dois modelos candidatos dados por: fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) e fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) Espero comparar esses …

10 r  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

Antes de fazer essa pergunta, pesquisei em nosso site e encontrei muitas perguntas semelhantes (como aqui , aqui e aqui ). Mas acho que essas perguntas relacionadas não foram bem respondidas ou discutidas, portanto, gostaria de levantar essa questão novamente. Eu acho que deve haver uma grande quantidade de audiência …

10 mixed-model  residuals  heteroscedasticity  diagnostic 

Eu tenho o seguinte modelo m_plotequipado com lme4::lmerefeitos aleatórios cruzados para participantes ( lfdn) e itens ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366 7.236 -0.05 0.17 -0.83 inference3 21.295 4.615 -0.03 0.22 0.86 …

10 mixed-model  lme4-nlme  intraclass-correlation 

Estou analisando os resultados de um experimento de tempo de reação em R. Executei uma ANOVA de medidas repetidas (1 fator dentro do sujeito com 2 níveis e 1 fator entre sujeitos com 2 níveis). Eu executei um modelo misto linear semelhante e queria resumir os resultados anteriores na forma …

10 anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme  degrees-of-freedom 

No modelo misto, assumimos que os efeitos aleatórios (parâmetros) são variáveis ​​aleatórias que seguem distribuições normais. Parece muito semelhante ao método bayesiano, no qual todos os parâmetros são assumidos como aleatórios. Então, o modelo de efeito aleatório é um caso especial do método bayesiano?

10 bayesian  mixed-model 

Sempre fui ensinado que efeitos aleatórios influenciam apenas a variação (erro) e que efeitos fixos influenciam apenas a média. Mas encontrei um exemplo em que efeitos aleatórios também influenciam a média - a estimativa do coeficiente: require(nlme) set.seed(128) n <- 100 k <- 5 cat <- as.factor(rep(1:k, each = n)) …

10 r  mixed-model  random-effects-model 

Há vários tópicos no R-sig-ME sobre a obtenção de intervalos de confiança para previsões usando lme4e nlmeem R. Por exemplo, aqui e aqui em 2010, incluindo alguns comentários de Dougals Bates, um dos autores de ambos os pacotes. Hesito em citá-lo literalmente, por medo de serem retirados do contexto, mas …

10 mixed-model 

Entendo o efeito de um efeito aleatório categórico em um modelo de efeitos mistos, na medida em que ele executa um agrupamento parcial das observações por nível no efeito aleatório, assumindo efetivamente que as observações não são independentes, mas apenas seus conjuntos parciais. Também para meu entendimento, nesse modelo, as …

10 mixed-model  random-effects-model