Perguntas com a marcação «r»

/ editar: Acompanhamento adicional agora você pode usar o irlba :: prcomp_irlba / edit: acompanhando meu próprio post. irlbaagora possui argumentos de "centro" e "escala", que permitem usá-lo para calcular componentes principais, por exemplo: pc <- M %*% irlba(M, nv=5, nu=0, center=colMeans(M), right_only=TRUE)$v Eu tenho um grande número Matrixde recursos …

31 r  pca  dimensionality-reduction  svd  matrix-decomposition 

É possível visualizar a saída da Análise de componentes principais de maneiras que fornecem mais informações do que apenas tabelas de resumo? É possível fazer isso quando o número de observações é grande, digamos ~ 1e4? E é possível fazer isso em R [outros ambientes são bem-vindos]?

31 r  data-visualization  pca  biplot 

Quero gerar o gráfico descrito no livro ElemStatLearn "Os elementos do aprendizado estatístico: mineração de dados, inferência e previsão. Segunda edição" de Trevor Hastie e Robert Tibshirani e Jerome Friedman. O enredo é: Gostaria de saber como posso produzir esse gráfico exato R, principalmente os gráficos e cálculos da grade …

31 r  data-visualization  k-nearest-neighbour 

Contexto: Em resposta a uma pergunta anterior sobre pesquisa reproduzível, Jake escreveu Um problema que descobrimos ao criar nosso arquivo JASA foi que as versões e padrões dos pacotes CRAN foram alterados. Portanto, nesse arquivo, também incluímos as versões dos pacotes que usamos. O sistema baseado em vinheta provavelmente será …

31 r  reproducible-research  project-management 

Eu encontrei algumas distribuições para as quais BUGS e R têm diferentes parametrizações: Normal, log-Normal e Weibull. Para cada uma delas, entendo que o segundo parâmetro usado por R precisa ser transformado inversamente (1 / parâmetro) antes de ser usado no BUGS (ou JAGS no meu caso). Alguém sabe de …

31 r  distributions  bugs  jags  parameterization 

Estou tentando analisar alguns dados usando um modelo de efeito misto. Os dados que eu coletei representam o peso de alguns animais jovens de diferentes genótipos ao longo do tempo. Estou usando a abordagem proposta aqui: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ Em particular, estou usando a solução 2 Então eu tenho algo como require(nlme) …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Eu gostaria de determinar a importância relativa de conjuntos de variáveis ​​para um randomForestmodelo de classificação em R. A importancefunção fornece a MeanDecreaseGinimétrica para cada preditor individual - é tão simples quanto resumir isso em cada preditor de um conjunto? Por exemplo: # Assumes df has variables a1, a2, b1, …

31 r  machine-learning  classification  random-forest 

É possível calcular valores de AIC ou BIC para modelos de regressão de laço e outros modelos regularizados em que os parâmetros estão inserindo apenas parcialmente a equação. Como se determina os graus de liberdade? Estou usando R para ajustar modelos de regressão de laço com a glmnet()função do glmnetpacote …

31 r  model-selection  lasso  aic  bic 

Estou tentando representar graficamente o número de ações dos usuários (neste caso, "curtidas") ao longo do tempo. Portanto, tenho "Número de ações" como meu eixo y, meu eixo x é o tempo (semanas) e cada linha representa um usuário. Meu problema é que quero analisar esses dados para um conjunto …

31 r  data-visualization 

Acho que R pode levar muito tempo para gerar gráficos quando milhões de pontos estão presentes - o que não é surpreendente, uma vez que os pontos são plotados individualmente. Além disso, essas parcelas costumam ser muito confusas e densas para serem úteis. Muitos dos pontos se sobrepõem e formam …

31 r  data-visualization 

Espero que alguém possa fornecer uma visão geral intuitiva do que é distribuição quase-binomial e o que ela faz. Estou particularmente interessado nestes pontos: Como o quasibinomial difere da distribuição binomial. Quando a variável de resposta é uma proporção (os valores de exemplo incluem 0,23, 0,11, 0,78, 0,98), um modelo …

30 r  generalized-linear-model  binomial  overdispersion  quasi-likelihood 

Fiquei me perguntando se alguém poderia me esclarecer sobre as diferenças atuais entre essas duas funções. Encontrei a seguinte pergunta: Como escolher a biblioteca nlme ou lme4 R para modelos de efeitos mistos? , mas isso data de alguns anos atrás. Essa é a vida inteira nos círculos de software. …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

Espero que esta seja uma pergunta que alguém aqui possa responder sobre a natureza da decomposição de somas de quadrados de um modelo de efeitos mistos adequado lmer(do pacote lme4 R). Primeiramente, devo dizer que estou ciente da controvérsia ao usar essa abordagem e, na prática, seria mais provável que …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Gostaria de saber se existe algum teste estatístico para "testar" o significado de uma distribuição bimodal. Quero dizer, quanto meus dados atendem à distribuição bimodal ou não? Em caso afirmativo, existe algum teste no programa R?

30 r  hypothesis-testing  distributions  bimodal 

Eu tenho um grande conjunto de dados e quero realizar uma redução de dimensionalidade. Agora, em todos os lugares que leio, posso usar o PCA para isso. No entanto, ainda não consigo entender o que fazer depois de calcular / executar o PCA. Em R isso é facilmente feito com …

30 r  pca