Perguntas com a marcação «efficiency»

Eu tenho vários problemas desafiadores de otimização global não convexa para resolver. Atualmente, uso o Optimization Toolbox do MATLAB (especificamente, fmincon()com o algoritmo = 'sqp'), o que é bastante eficaz . No entanto, a maior parte do meu código está em Python, e eu adoraria fazer a otimização em Python …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Uma das principais questões com as quais temos de lidar em simulações moleculares é o cálculo de forças dependentes da distância. Se pudermos restringir as funções de força e distância para ter potências iguais da distância de separação , podemos calcular o quadrado da distância r 2 = r ⋅ …

26 efficiency 

Estou executando simulações de dinâmica molecular (MD) usando vários pacotes de software, como Gromacs e DL_POLY. O Gromacs agora suporta os algoritmos de decomposição de partículas e de domínio. Por padrão, as simulações do Gromacs usam a decomposição de domínio, embora por muitos anos, até recentemente, a decomposição de partículas …

15 parallel-computing  efficiency  molecular-dynamics  simulation 

Meu grupo de pesquisa se concentra na dinâmica molecular, que obviamente pode gerar gigabytes de dados como parte de uma única trajetória que deve ser analisada. Vários dos problemas com os quais estamos preocupados envolvem correlações no conjunto de dados, o que significa que precisamos acompanhar grandes quantidades de dados …

15 python  c  efficiency 

Eu li que, por exemplo, se eu tenho um forloop duplo que percorre os índices de uma matriz, é mais eficiente colocar o índice de execução da coluna no loop externo. Por exemplo: a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end Qual é a maneira mais eficiente de codificá-lo se …

12 matlab  efficiency 

Estou interessado em estabelecer cálculos para verificar se um critério de distância é atendido: ou seja, a distância entre um vetor vetor x j deve ser menor que algum valor r m a x . Meus dados são particionados de acordo com uma grade ortogonal de coordenadas. Como meu ponto …

12 efficiency 

A diferenciação automática nos permite avaliar numericamente a derivada de um programa em uma entrada específica. Existe um teorema de que esse cálculo pode ser feito a um custo inferior a cinco vezes o custo para executar o programa original. Esse fator de cinco é um limite superior. Em que …

12 automatic-differentiation  efficiency 

Fechadas. Esta questão está fora de tópico . No momento, não está aceitando respostas. Deseja melhorar esta pergunta? Atualize a pergunta para que ela esteja no tópico do Computational Science Stack Exchange. Fechado há 5 anos . Existe um grau de complexidade maior que e menor que O ( n …

10 algorithms  complexity  efficiency 

Estou tentando entender a diferença entre essas duas placas gráficas para computação acadêmica, especificamente para o componente DGEMM. Se olharmos para as estatísticas brutas, ambas têm o mesmo chip GK110, estatísticas comparáveis ​​em praticamente todas as categorias e, acredito, têm a mesma arquitetura principal. Antes de qualquer desconto, o K20X …

10 performance  gpu  efficiency 

Qual é a maneira mais avançada de implementar funções especiais de precisão dupla? Preciso da seguinte integral: para e , que pode ser escrita em termos da função gama incompleta inferior. Aqui está minha implementação de Fortran e C: m=0,1,2,. . . t>0Fm( t ) = ∫1 10 0você2 me- …

10 efficiency  accuracy  special-functions