Ciência computacional

Alguém tem recomendações sobre uma biblioteca de matrizes C ++ rápida e utilizável? O que quero dizer com utilizável é o seguinte: Os objetos de matriz têm uma interface intuitiva (por exemplo: eu posso usar linhas e colunas durante a indexação) Eu posso fazer qualquer coisa com a classe matrix …

158 linear-algebra  software  implicit-methods 

Estou fortemente convencido do valor de usar testes que verificam um programa completo (por exemplo, testes de convergência), incluindo um conjunto automatizado de testes de regressão . Depois de ler alguns livros de programação, tive a sensação incômoda de que "deveria" escrever testes de unidade (ou seja, testes que verificam …

89 programming-paradigms  testing 

Portanto, tenho uma cabeça decente para quais problemas com os quais trabalho são os melhores em série e que podem ser gerenciados em paralelo. Mas, no momento, não tenho muita idéia do que é melhor manipulado pela computação baseada em CPU e do que deve ser transferido para uma GPU. …

84 gpu 

Eu tenho vários problemas desafiadores de otimização global não convexa para resolver. Atualmente, uso o Optimization Toolbox do MATLAB (especificamente, fmincon()com o algoritmo = 'sqp'), o que é bastante eficaz . No entanto, a maior parte do meu código está em Python, e eu adoraria fazer a otimização em Python …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Esta pergunta é uma extensão de duas discussões que surgiram recentemente nas respostas a " C ++ vs Fortran for HPC ". E é um pouco mais um desafio do que uma pergunta ... Um dos argumentos mais ouvidos em favor do Fortran é que os compiladores são apenas melhores. …

74 fortran  c  blas  benchmarking 

Trabalho em ciência da computação e, como resultado, passo uma quantidade não trivial do meu tempo tentando aumentar a taxa de transferência científica de muitos códigos, além de entender a eficiência desses códigos. Vamos supor que eu avaliei a troca desempenho versus legibilidade / reutilização / manutenibilidade do software em …

66 performance 

No meu programa de doutorado em ciências computacionais, estamos trabalhando quase exclusivamente em C ++ e Fortran. Parece que alguns professores preferem um ao outro. Eu estou querendo saber qual é 'melhor' ou se é melhor que o outro em uma determinada circunstância.

56 hpc  fortran  c++  languages 

O algoritmo Fast Fourier Transform calcula uma decomposição de Fourier sob a suposição de que seus pontos de entrada estão igualmente espaçados no domínio do tempo, . E se não estiverem? Existe outro algoritmo que eu poderia usar, ou alguma forma de modificar a FFT, para explicar o que é …

55 fourier-analysis 

Estou pensando em aprender uma nova linguagem para usar em projetos de modelagem numérica / simulação, como uma substituição (parcial) para o C ++ e Python que atualmente uso. Me deparei com Julia , o que parece perfeito. Se ele fizer tudo o que afirma, eu poderia usá-lo para substituir …

55 parallel-computing  languages  julia 

Muitos algoritmos numéricos (integração, diferenciação, interpolação, funções especiais etc.) estão disponíveis em bibliotecas de computação científica, como GSL . Mas muitas vezes vejo código com implementações "roladas manualmente" dessas funções. Para pequenos programas que não são necessariamente destinados à distribuição pública, é prática comum entre os cientistas da computação implementar …

54 libraries  c 

Todo cientista precisa saber um pouco sobre estatística: o que significa correlação, o que é um intervalo de confiança e assim por diante. Da mesma forma, todo cientista deve saber um pouco sobre computação: a questão é: o que? O que é razoável esperar que todo cientista que trabalha saiba …

52 education 

Sistemas lineares esparsos aparecem com crescente frequência nas aplicações. Um deles tem muitas rotinas para escolher para resolver esses sistemas. No nível mais alto, existe um divisor de águas entre os métodos diretos (por exemplo, eliminação Gaussiana esparsa ou decomposição de Cholesky, com algoritmos especiais de ordenação e métodos multifrontais) …

49 linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix 

Existe uma diferença óbvia entre a diferença finita e o método do volume finito (passando da definição de ponto das equações para médias integrais sobre as células). Mas acho que o FEM e o FVM são muito semelhantes; ambos usam forma integral e média sobre as células. Qual é o …

48 finite-element  finite-volume 

Estou acostumado a pensar nas diferenças finitas como um caso especial de elementos finitos, em uma grade muito restrita. Então, quais são as condições de como escolher entre o Método das Diferenças Finitas (FDM) e o Método dos Elementos Finitos (MEF) como método numérico? Do lado do Método das Diferenças …

46 pde  finite-element 

Muitas vezes, quando eu herdei ou encontrei código científico escrito por outras pessoas (ou ocasionalmente, até meu próprio trabalho), notei que a documentação é esparsa ou inexistente. Se tiver sorte, vejo comentários informativos. Se eu tiver muita sorte, há até comentários Doxygen e um Doxyfile para que eu tenha interfaces …

44 software  documentation