Perguntas com a marcação «r»

Eu tinha uma pergunta sobre como interpretar os gráficos gerados pelo gráfico (lm) em R. Eu queria saber se vocês poderiam me dizer como interpretar os gráficos de localização em escala e alavancagem-residual? Quaisquer comentários serão apreciados. Assumir conhecimentos básicos de estatística, regressão e econometria.

89 r  regression  data-visualization  residuals  outliers 

Aqui está como eu entendi os efeitos aleatórios aninhados x cruzados: Os efeitos aleatórios aninhados ocorrem quando um fator de nível inferior aparece apenas dentro de um nível específico de um fator de nível superior. Por exemplo, alunos dentro das aulas em um ponto fixo no tempo. Em lme4pensei que …

88 r  mixed-model  multilevel-analysis  lme4-nlme 

Se estivermos montando um glmer, podemos receber um aviso informando que o modelo está encontrando dificuldades para convergir ... por exemplo >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| = 0.00389462 (tol = 0.001) Outra maneira de verificar a convergência discutida neste …

88 r  mixed-model  lme4-nlme 

Ajustar uma regressão logística usando lme4 termina com Error in mer_finalize(ans) : Downdated X'X is not positive definite. Uma causa provável desse erro é aparentemente uma deficiência de classificação. O que é deficiência de classificação e como devo resolvê-la?

87 r  logistic  lme4-nlme 

Eu tenho encaixar alguns modelos de efeitos mistos (particularmente modelos longitudinais) usando lme4em Rmas gostaria de realmente dominar os modelos e o código que se passa com eles. No entanto, antes de mergulhar com os dois pés (e comprar alguns livros), quero ter certeza de que estou aprendendo a biblioteca …

85 r  mixed-model  lme4-nlme 

Estou interessado em aprender R barato. Qual é o melhor recurso / livro / tutorial gratuito para aprender R?

78 r  references 

Estou começando a se envolver com o uso de glmnetcom LASSO Regressão onde meu desfecho de interesse é dicotômica. Criei um pequeno quadro de dados simulado abaixo: age <- c(4, 8, 7, 12, 6, 9, 10, 14, 7) gender <- c(1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0) bmi_p …

78 r  self-study  lasso  regression  interpretation  anova  statistical-significance  survey  conditional-probability  independence  naive-bayes  graphical-model  r  time-series  forecasting  arima  r  forecasting  exponential-smoothing  bootstrap  outliers  r  regression  poisson-distribution  zero-inflation  genetic-algorithms  machine-learning  feature-selection  cart  categorical-data  interpretation  descriptive-statistics  variance  multivariate-analysis  covariance-matrix  r  data-visualization  generalized-linear-model  binomial  proportion  pca  matlab  svd  time-series  correlation  spss  arima  chi-squared  curve-fitting  text-mining  zipf  probability  categorical-data  distance  group-differences  bhattacharyya  regression  variance  mean  data-visualization  variance  clustering  r  standard-error  association-measure  somers-d  normal-distribution  integral  numerical-integration  bayesian  clustering  python  pymc  nonparametric-bayes  machine-learning  svm  kernel-trick  hyperparameter  poisson-distribution  mean  continuous-data  univariate  missing-data  dag  python  likelihood  dirichlet-distribution  r  anova  hypothesis-testing  statistical-significance  p-value  rating  data-imputation  censoring  threshold 

Estou usando o algoritmo de floresta aleatória como um classificador robusto de dois grupos em um estudo de microarray com milhares de recursos. Qual é a melhor maneira de apresentar a floresta aleatória para que haja informações suficientes para torná-la reproduzível em um artigo? Existe um método de plotagem em …

75 r  machine-learning  classification  random-forest  microarray 

Estou tentando entender a diferença entre diferentes métodos de reamostragem (simulação de Monte Carlo, inicialização paramétrica, inicialização não paramétrica, jackknifing, validação cruzada, validação cruzada, testes de randomização e testes de permutação) e sua implementação no meu próprio contexto usando R. Digamos que eu tenha a seguinte situação - desejo executar …

74 r  bootstrap  resampling  jackknife  permutation-test 

Existe alguma GUI para R que facilite para um iniciante o aprendizado e a programação nesse idioma?

73 r 

Como posso remover linhas duplicadas desse quadro de dados de exemplo? A 1 A 1 A 2 B 4 B 1 B 1 C 2 C 2 Gostaria de remover as duplicatas com base nas duas colunas: A 1 A 2 B 4 B 1 C 2 A ordem não …

71 r 

A pergunta: existem bons exemplos de pesquisas reproduzíveis usando R disponíveis gratuitamente on-line? Exemplo ideal: Especificamente, os exemplos ideais forneceriam: Os dados brutos (e idealmente metadados explicando os dados), Todo o código R, incluindo importação, processamento, análise e geração de dados, Sweave ou alguma outra abordagem para vincular a saída …

71 r  references  reproducible-research 

Para um estudo de simulação, eu tenho que gerar variáveis ​​aleatórias que mostram uma correlação pré-definida (população) com uma variável existente YYY. Examinei os Rpacotes copulae CDVineque podem produzir distribuições multivariadas aleatórias com uma determinada estrutura de dependência. No entanto, não é possível corrigir uma das variáveis ​​resultantes em uma …

71 r  correlation  random-variable  random-generation  independence  assumptions  random-variable  unbiased-estimator  regression  hypothesis-testing  heteroscedasticity  generalized-least-squares  distributions  networks  data-visualization  sas  reproducible-research  philosophical  time-series  variance  outliers  quality-control  mean  multilevel-analysis  average  weighted-mean  regression  confidence-interval  prediction-interval  correlation  matlab  matrix  data-mining  maximum-likelihood  r  time-series  survival  predictive-models 

Comparei ?prcompe ?princompencontrei algo sobre a análise de componentes principais (QA) e modo Q (modo principal) (PCA). Mas honestamente - eu não entendo. Alguém pode explicar a diferença e talvez até explicar quando aplicar qual?

70 r  pca 

Eu tenho 2 variáveis ​​dependentes (DVs), cada uma cuja pontuação pode ser influenciada pelo conjunto de 7 variáveis ​​independentes (IVs). Os DVs são contínuos, enquanto o conjunto de IVs consiste em uma mistura de variáveis ​​codificadas contínuas e binárias. (No código abaixo, variáveis ​​contínuas são escritas em letras maiúsculas e …

68 r  multivariate-analysis  manova  multiple-regression  multivariate-regression