Perguntas com a marcação «mixed-model»

Atualmente, estou usando o pacote R lme4 . Estou usando um modelo linear de efeitos mistos com efeitos aleatórios: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # …

37 r  regression  mixed-model  random-effects-model 

EffectsO pacote fornece uma maneira muito rápida e conveniente de plotar resultados lineares de modelo de efeito misto obtidos através do lme4pacote . A effectfunção calcula intervalos de confiança (ICs) muito rapidamente, mas quão confiáveis são esses intervalos de confiança? Por exemplo: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- lmer(strength ~ …

36 r  mixed-model  confidence-interval  effects  lme4-nlme 

Sob quais condições alguém deve considerar o uso de análise multinível / hierárquica em oposição a análises mais básicas / tradicionais (por exemplo, ANOVA, regressão OLS, etc.)? Existem situações em que isso possa ser considerado obrigatório? Existem situações em que o uso de análise multinível / hierárquica é inadequado? Finalmente, …

36 mixed-model  multilevel-analysis 

I recentemente realizado que um modelo-misturado com apenas sujeito como um factor aleatório e os outros factores, como factores fixos é equivalente a uma ANOVA quando definindo a estrutura de correlação do modelo misto de simetria composto. Portanto, eu gostaria de saber o que significa simetria composta no contexto de …

35 correlation  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Eu tenho dados coletados de um experimento organizado da seguinte maneira: Dois locais, cada um com 30 árvores. 15 são tratados, 15 são controle em cada local. De cada árvore, amostramos três pedaços do caule e três pedaços das raízes, de modo que 6 amostras de nível 1 por árvore …

34 r  mixed-model  model  nested-data  lme4-nlme 

Estou tentando entender quando usar um efeito aleatório e quando é desnecessário. Foi-me dito uma regra prática: se você tem 4 ou mais grupos / indivíduos, eu (15 alces individuais). Alguns desses alces foram experimentados 2 ou 3 vezes, para um total de 29 tentativas. Quero saber se eles se …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Eu estou querendo saber quais são as diferenças entre GLMs mistos e não misturados. Por exemplo, no SPSS, o menu suspenso permite que os usuários se ajustem: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Eles lidam com valores ausentes de maneira diferente? Minha variável …

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

Caro pessoal, notei algo estranho que não sei explicar, não é? Em resumo: a abordagem manual para calcular um intervalo de confiança em um modelo de regressão logística e a função R confint()fornecem resultados diferentes. Eu tenho passado pela regressão logística aplicada de Hosmer & Lemeshow (2ª edição). No terceiro …

34 r  regression  logistic  confidence-interval  profile-likelihood  correlation  mcmc  error  mixture  measurement  data-augmentation  r  logistic  goodness-of-fit  r  time-series  exponential  descriptive-statistics  average  expected-value  data-visualization  anova  teaching  hypothesis-testing  multivariate-analysis  r  r  mixed-model  clustering  categorical-data  unsupervised-learning  r  logistic  anova  binomial  estimation  variance  expected-value  r  r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures  project-management  r  poisson-distribution  control-chart  project-management  regression  residuals  r  distributions  data-visualization  r  unbiased-estimator  kurtosis  expected-value  regression  spss  meta-analysis  r  censoring  regression  classification  data-mining  mixture 

Eu tenho um modelo de efeito misto (de fato, um modelo misto aditivo generalizado) que me fornece previsões para séries temporais. Para combater a autocorrelação, eu uso um modelo corCAR1, pois tenho dados ausentes. Os dados devem fornecer uma carga total, portanto, preciso somar todo o intervalo de previsão. Mas …

32 mixed-model  variance  random-variable 

Quero ajustar um GLMM multinível com uma distribuição Poisson (com excesso de dispersão) usando R. No momento, estou usando o lme4, mas notei que recentemente a quasipoissonfamília foi removida. Já vi em outro lugar que você pode modelar a super dispersão aditiva para distribuições binomiais adicionando uma interceptação aleatória com …

32 r  mixed-model  poisson-distribution  lme4-nlme  overdispersion 

Estou tentando analisar alguns dados usando um modelo de efeito misto. Os dados que eu coletei representam o peso de alguns animais jovens de diferentes genótipos ao longo do tempo. Estou usando a abordagem proposta aqui: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ Em particular, estou usando a solução 2 Então eu tenho algo como require(nlme) …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Fiquei me perguntando se alguém poderia me esclarecer sobre as diferenças atuais entre essas duas funções. Encontrei a seguinte pergunta: Como escolher a biblioteca nlme ou lme4 R para modelos de efeitos mistos? , mas isso data de alguns anos atrás. Essa é a vida inteira nos círculos de software. …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

Espero que esta seja uma pergunta que alguém aqui possa responder sobre a natureza da decomposição de somas de quadrados de um modelo de efeitos mistos adequado lmer(do pacote lme4 R). Primeiramente, devo dizer que estou ciente da controvérsia ao usar essa abordagem e, na prática, seria mais provável que …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Gostaria de obter um valor-p e um tamanho de efeito de uma variável categórica independente (com vários níveis) - que é "geral" e não para cada nível separadamente, como é o resultado normal de lme4R. É exatamente como a coisa que as pessoas relatam ao executar uma ANOVA. Como posso …

28 r  hypothesis-testing  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Espero que todos não se importem com essa pergunta, mas preciso de ajuda para interpretar a saída de um modelo linear de efeitos mistos que tenho tentado aprender na R. Sou novo na análise de dados longitudinal e na regressão linear de efeitos mistos. Eu tenho um modelo que me …

28 r  mixed-model  interpretation  panel-data