Perguntas com a marcação «false-discovery-rate»

Benjamini e Hochberg desenvolveram o primeiro (e ainda mais utilizado, eu acho) método para controlar a taxa de falsas descobertas (FDR). Quero começar com um monte de valores P, cada um para uma comparação diferente, e decidir quais são baixos o suficiente para serem chamados de "descoberta", controlando o FDR …

36 multiple-comparisons  non-independent  false-discovery-rate 

Meu programa de estatística implementa os procedimentos de Benjamini & Hochberg (1995) e Benjamini & Yekutieli (2001) taxa de descoberta falsa (FDR). Fiz o possível para ler o artigo posterior, mas ele é matematicamente denso e não estou razoavelmente certo de que entendo a diferença entre os procedimentos. Eu posso …

34 post-hoc  false-discovery-rate 

Eu tenho tentado entender como a Taxa de Falsas Descobertas (FDR) deve informar as conclusões de cada pesquisador. Por exemplo, se seu estudo estiver com pouca potência, você deve descontar seus resultados mesmo que sejam significativos em ? Nota: Eu estou falando sobre o FDR no contexto de examinar os …

30 statistical-significance  p-value  publication-bias  false-discovery-rate 

Sabemos que devemos aplicar correções do tipo Benjamini Hochberg para testes de múltiplas hipóteses a experimentos com base em um único conjunto de dados, a fim de controlar a taxa de falsas descobertas, caso contrário, todos os experimentos que dão um resultado positivo podem ser falsos. Mas por que não …

24 hypothesis-testing  multiple-comparisons  bonferroni  false-discovery-rate 

Esta pergunta foi feita antes aqui e aqui, mas não acho que as respostas abordem a questão diretamente. Os estudos com pouca capacidade aumentam a probabilidade de falsos positivos? Alguns artigos de notícias fazem essa afirmação. Por exemplo : Baixo poder estatístico é uma má notícia. Estudos com baixa potência …

23 hypothesis-testing  power  false-discovery-rate 

A citação a seguir vem do famoso artigo de pesquisa Estatística significativa para estudos genômicos de Storey & Tibshirani (2003): Por exemplo, uma taxa de falso positivo de 5% significa que, em média, 5% dos recursos verdadeiramente nulos no estudo serão considerados significativos. Um FDR (taxa de descoberta falsa) de …

20 hypothesis-testing  false-discovery-rate  type-i-and-ii-errors  confusion-matrix  false-positive-rate 

Eu li este excelente artigo de David Colquhoun: Uma investigação sobre a taxa de falsas descobertas e a má interpretação dos valores-p (2014). Em essência, ele explica por que a taxa de falsas descobertas (FDR) pode chegar a , apesar de controlarmos o erro do tipo I com30 %30%30\% .α …

19 hypothesis-testing  statistical-significance  p-value  multiple-comparisons  false-discovery-rate 

Tanto na literatura sobre a taxa de erro familiar (FWER) quanto na taxa de falsas descobertas (FDR), métodos particulares de controle da FWER ou FDR são considerados apropriados para testes dependentes ou independentes. Por exemplo, no artigo de 1979 "Um procedimento simples de teste múltiplo sequencialmente rejeitivo", Holm escreveu para …

18 multiple-comparisons  independence  non-independent  familywise-error  false-discovery-rate 

Eu li que controlar o FDR é menos rigoroso do que controlar o FWER, como na Wikipedia : Os procedimentos de controle de FDR exercem um controle menos rigoroso sobre a descoberta falsa em comparação com os procedimentos da taxa de erro familiar (FWER) (como a correção de Bonferroni). Isso …

16 hypothesis-testing  multiple-comparisons  false-discovery-rate 

Os testes de permutação (também chamados de teste de randomização, teste de re-randomização ou teste exato) são muito úteis e úteis quando a suposição de distribuição normal exigida por, por exemplo, t-testnão é atendida e quando a transformação dos valores pela classificação do teste não-paramétrico como Mann-Whitney-U-testlevaria a mais informações …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

Existe uma maneira simples de explicar por que o procedimento de Benjamini e Hochberg (1995) realmente controla a taxa de descoberta falsa (FDR)? Esse procedimento é tão elegante e compacto e, no entanto, a prova do porquê ele funciona sob independência (aparecendo no apêndice do artigo de 1995 ) não …

14 intuition  false-discovery-rate  teaching 

Eu entendo o procedimento e o que ele controla. Então, qual é a fórmula para o valor de p ajustado no procedimento BH para comparações múltiplas? Só agora eu percebi que o BH original não produzia valores p ajustados, apenas ajustava a condição de (não) rejeição: https://www.jstor.org/stable/2346101 . Gordon Smyth …

14 hypothesis-testing  p-value  multiple-comparisons  false-discovery-rate 

Alguém pode explicar como os procedimentos de FDR são capazes de estimar um FDR sem um modelo / suposição da taxa básica de verdadeiros positivos?

9 false-discovery-rate 

Eu tenho um conjunto de dados em que testo diferenças significativas entre três populações com relação a cerca de 50 variáveis ​​diferentes. Faço isso usando os testes de Kruskal-Wallis, por um lado, e por testes de razão de verossimilhança do modelo GLM aninhado (por e sem população como uma variável …

9 chi-squared  multiple-comparisons  likelihood-ratio  kruskal-wallis  false-discovery-rate 

Eu tenho uma tabela tridimensional de tamanho . Cada célula da tabela é um teste de hipótese. Dividir a tabela na terceira dimensão produz 81 conjuntos de testes de hipóteses que são independentes entre os conjuntos, mas dependem dos mesmos. Originalmente, eu pensava que poderia controlar a taxa de falsas …

9 multiple-comparisons  false-discovery-rate