Perguntas com a marcação «mgcv»

Eu uso GAMs cada vez mais. Quando forneço referências para seus vários componentes (seleção de parâmetros de suavização, várias bases de spline, valores de p de termos suaves), todos eles pertencem a um pesquisador - Simon Wood, na Universidade de Bath, na Inglaterra. Ele também é o mantenedor de mgcvR, …

19 nonparametric  gam  mgcv  academia  semiparametric 

Estou tentando descobrir como controlar os parâmetros de suavização em um modelo mgcv: gam. Eu tenho uma variável binomial que estou tentando modelar principalmente como uma função das coordenadas xey em uma grade fixa, além de outras variáveis ​​com influências menores. No passado, eu construí um modelo de regressão local …

14 r  smoothing  mgcv 

Eu estive explorando várias ferramentas de previsão e constatei que os Modelos Aditivos Generalizados (GAMs) têm o maior potencial para essa finalidade. GAMs são ótimos! Eles permitem que modelos complexos sejam especificados de maneira muito sucinta. No entanto, essa mesma sucessão está me causando alguma confusão, especificamente no que diz …

12 r  modeling  gam  mgcv 

O mgcvpacote para Rpossui duas funções para ajustar as interações do produto tensorial: te()e ti(). Entendo a divisão básica do trabalho entre os dois (ajustando uma interação não linear versus decompondo essa interação em efeitos principais e uma interação). O que não entendo é o porquê te(x1, x2)e ti(x1) + …

11 r  gam  mgcv  conditional-probability  mixed-model  references  bayesian  estimation  conditional-probability  machine-learning  optimization  gradient-descent  r  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  time-series  bayesian  inference  change-point  time-series  anova  repeated-measures  statistical-significance  bayesian  contingency-tables  regression  prediction  quantiles  classification  auc  k-means  scikit-learn  regression  spatial  circular-statistics  t-test  effect-size  cohens-d  r  cross-validation  feature-selection  caret  machine-learning  modeling  python  optimization  frequentist  correlation  sample-size  normalization  group-differences  heteroscedasticity  independence  generalized-least-squares  lme4-nlme  references  mcmc  metropolis-hastings  optimization  r  logistic  feature-selection  separation  clustering  k-means  normal-distribution  gaussian-mixture  kullback-leibler  java  spark-mllib  data-visualization  categorical-data  barplot  hypothesis-testing  statistical-significance  chi-squared  type-i-and-ii-errors  pca  scikit-learn  conditional-expectation  statistical-significance  meta-analysis  intuition  r  time-series  multivariate-analysis  garch  machine-learning  classification  data-mining  missing-data  cart  regression  cross-validation  matrix-decomposition  categorical-data  repeated-measures  chi-squared  assumptions  contingency-tables  prediction  binary-data  trend  test-for-trend  matrix-inverse  anova  categorical-data  regression-coefficients  standard-error  r  distributions  exponential  interarrival-time  copula  log-likelihood  time-series  forecasting  prediction-interval  mean  standard-error  meta-analysis  meta-regression  network-meta-analysis  systematic-review  normal-distribution  multiple-regression  generalized-linear-model  poisson-distribution  poisson-regression  r  sas  cohens-kappa 

Estou interessado em modelar a captura total de peixes usando gam em mgcv para modelar efeitos aleatórios simples para navios individuais (que fazem viagens repetidas ao longo do tempo na pesca). Eu tenho 98 sujeitos, então pensei em usar gam em vez de gamm para modelar os efeitos aleatórios. Meu …

10 prediction  random-effects-model  gam  mgcv 

Meu nome é Hugh e sou um estudante de doutorado usando modelos aditivos generalizados para fazer algumas análises exploratórias. Não tenho certeza de como interpretar os valores-p que vêm do pacote MGCV e gostaria de verificar meu entendimento (estou usando a versão 1.7-29 e consultei algumas das documentações de Simon …

10 p-value  mgcv 

Minhas perguntas tratam de GAMs no pacote mgcv R. Devido a um pequeno tamanho de amostra, desejo determinar o erro de previsão usando a validação cruzada de exclusão única. Isso é razoável? Existe um pacote ou código como eu posso fazer isso? A errorest()função no pacote ipred não funciona. Um …

10 r  cross-validation  gam  mgcv 

O livro de Simon Wood sobre GAMs e seu pacote R associado mgcv são altamente detalhados e informativos quando se trata da teoria do GAM e do ajuste de modelos a dados reais e simulados. Para suavizações 1D, não há realmente muito com o que se preocupar, exceto decidir se …

9 r  mgcv 

Gostaria de descobrir os valores (x, y)usados ​​na plotagem plot(b, seWithMean=TRUE)no pacote mgcv . Alguém sabe como posso extrair ou calcular esses valores? Aqui está um exemplo: library(mgcv) set.seed(0) dat <- gamSim(1, n=400, dist="normal", scale=2) b <- gam(y~s(x0), data=dat) plot(b, seWithMean=TRUE)

9 r  time-series  smoothing  mgcv 

Estou procurando neste site um workshop sobre o GAM em R: http://qcbs.ca/wiki/r_workshop8 No final da seção, 2. Multiple smooth termseles mostram um exemplo, onde eles usam anovapara comparar três modelos diferentes para determinar o melhor modelo de ajuste. A saída é Analysis of Deviance Table Model 1: y ~ x0 …

9 r  anova  gam  mgcv 

Comecei a trabalhar com o GAM em R e adquiri o excelente livro de Simon Wood sobre o tópico ( "Modelos aditivos generalizados, uma introdução ao R" ). Com base em um de seus exemplos, estou analisando o seguinte: library(mgcv) data(trees) ct1<-gam(log(Volume) ~ Height + s(Girth), data=trees) Eu tenho duas …

9 r  regression  machine-learning  gam  mgcv 

A pergunta a seguir se baseia na discussão encontrada nesta página . Dada uma variável de resposta y, uma variável explicativa contínua xe um fator fac, é possível definir um Modelo Aditivo Geral (GAM) com uma interação entre xe facusando o argumento by=. De acordo com o arquivo de ajuda …

8 r  interaction  gam  mgcv 

Estou construindo um modelo no qual várias de minhas covariáveis ​​vivem em um "círculo", no sentido em que assumem valores no intervalo [0,1) e 0 = 1. Estou pensando em técnicas para lidar com essa situação. Uma idéia é representar uma variável circular teta como um par de variáveis ​​(sin …

8 data-transformation  seasonality  mgcv  circular-statistics